More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2716 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  100 
 
 
302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  48.51 
 
 
340 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  48.75 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  33.98 
 
 
412 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  34.98 
 
 
280 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  31.25 
 
 
351 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  37.57 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  29.36 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  31.98 
 
 
297 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 
291 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  32.72 
 
 
425 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  27.46 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  35.44 
 
 
280 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 
407 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  29.02 
 
 
280 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
289 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 
291 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  33.49 
 
 
287 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 
283 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  34.83 
 
 
369 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  35.35 
 
 
397 aa  106  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
284 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  30.91 
 
 
302 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 
297 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 
283 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  32.49 
 
 
284 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  30.62 
 
 
283 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  29.86 
 
 
455 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  29.51 
 
 
313 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  31.98 
 
 
280 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 
279 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  29.61 
 
 
287 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 
408 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  30.94 
 
 
284 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  31.22 
 
 
281 aa  99.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  34.8 
 
 
378 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  29.86 
 
 
280 aa  99.4  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  30.24 
 
 
289 aa  99  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 
397 aa  99  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  31.5 
 
 
352 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  34.03 
 
 
438 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.42 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 
353 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25.95 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  35.64 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  33.65 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  32.46 
 
 
415 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  31.7 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  33 
 
 
724 aa  93.2  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  30.24 
 
 
275 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  28.02 
 
 
304 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.64 
 
 
412 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  30.33 
 
 
280 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 
290 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  30.11 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  28.77 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  29 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  27.01 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  30.17 
 
 
505 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  27.8 
 
 
274 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  29.35 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 
299 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 
297 aa  89.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 
299 aa  89  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  29.47 
 
 
281 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  29.29 
 
 
517 aa  86.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 
544 aa  86.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  32.26 
 
 
274 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  32.26 
 
 
274 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  32.26 
 
 
274 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  33.15 
 
 
274 aa  85.9  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  27.72 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  32.26 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  32.61 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  32.02 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  29.86 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  28.71 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  26.99 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  31.32 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  31.32 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  29.38 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  26.67 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  32.49 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  27.62 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  31.79 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  28.92 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  32.37 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  24.77 
 
 
912 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  27.54 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>