More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0643 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
425 aa  862    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  37.65 
 
 
412 aa  282  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 
407 aa  261  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  36.93 
 
 
455 aa  231  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  37.58 
 
 
351 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 
408 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  34.48 
 
 
289 aa  193  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  35.21 
 
 
289 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  35.21 
 
 
291 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
291 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  35.4 
 
 
283 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  33.43 
 
 
415 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 
291 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  36.15 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  37.81 
 
 
352 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  36.7 
 
 
287 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 
279 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  30.89 
 
 
397 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  34.32 
 
 
373 aa  149  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 
353 aa  147  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 
378 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  32.12 
 
 
274 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 
283 aa  136  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  32.26 
 
 
369 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 
284 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 
283 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  31.14 
 
 
300 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  28.62 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  31.44 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 
282 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  38.16 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 
397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  31.32 
 
 
279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  30.88 
 
 
284 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  30.26 
 
 
280 aa  130  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  32.34 
 
 
284 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  31.02 
 
 
281 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  31.96 
 
 
282 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  27.46 
 
 
517 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.73 
 
 
280 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 
280 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 
280 aa  122  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 
284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 
299 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  31.67 
 
 
279 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  29.12 
 
 
297 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  29.95 
 
 
284 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 
297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  27.83 
 
 
297 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  30.59 
 
 
276 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  28.12 
 
 
505 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
299 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  29.03 
 
 
303 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  28.1 
 
 
280 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  27.94 
 
 
302 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  25.32 
 
 
358 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  36.08 
 
 
340 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  32.72 
 
 
302 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  30.9 
 
 
284 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 
284 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  27.78 
 
 
305 aa  111  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  27.67 
 
 
283 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 
292 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 
285 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  29.59 
 
 
287 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  29.08 
 
 
281 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  32.35 
 
 
509 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  26.73 
 
 
283 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  28.36 
 
 
285 aa  107  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
293 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
285 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  32.22 
 
 
293 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  29.09 
 
 
716 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  27.36 
 
 
650 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 
287 aa  103  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 
298 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 
412 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  29.21 
 
 
388 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 
290 aa  100  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  31.55 
 
 
718 aa  100  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  29.23 
 
 
304 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  29.64 
 
 
275 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  27.14 
 
 
292 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  25.78 
 
 
456 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 
544 aa  98.6  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  27.68 
 
 
275 aa  97.1  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  28.06 
 
 
279 aa  97.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  30.59 
 
 
512 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 
280 aa  93.2  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  26.82 
 
 
313 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  27.35 
 
 
730 aa  92  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  30.13 
 
 
292 aa  90.5  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  28.05 
 
 
289 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  28.38 
 
 
275 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  25.85 
 
 
299 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.52 
 
 
298 aa  87.8  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.27 
 
 
634 aa  87  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>