More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2081 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  53.51 
 
 
340 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  48.75 
 
 
302 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
280 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 
412 aa  135  8e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  36.48 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  34.8 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  30.54 
 
 
351 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  33.74 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  35.81 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  28.36 
 
 
297 aa  125  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  31.72 
 
 
279 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  37.26 
 
 
352 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  29.2 
 
 
274 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  32.87 
 
 
286 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  35.27 
 
 
287 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  31.06 
 
 
284 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  28.82 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  33.46 
 
 
378 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  32.5 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  29.22 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  30 
 
 
289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
289 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  28.92 
 
 
291 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 
291 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  35.27 
 
 
415 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  30.36 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  28.75 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  31.98 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  32.06 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  32.71 
 
 
293 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 
283 aa  109  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 
283 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  32.64 
 
 
274 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  30.74 
 
 
369 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  29.77 
 
 
303 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  34.08 
 
 
407 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  30.63 
 
 
297 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  32.23 
 
 
274 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  32.23 
 
 
274 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  29.28 
 
 
425 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25.93 
 
 
305 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25.32 
 
 
297 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 
283 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  29.63 
 
 
281 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
455 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 
299 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 
287 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 
299 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  33.18 
 
 
279 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  27.88 
 
 
284 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 
280 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 
408 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  31.86 
 
 
274 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 
297 aa  102  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.47 
 
 
412 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  31.1 
 
 
275 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  30.28 
 
 
505 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  28.83 
 
 
283 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 
353 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  30.51 
 
 
456 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 
397 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  31.72 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  29.02 
 
 
280 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  31.72 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 
397 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 
544 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  26.21 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  31.72 
 
 
274 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  26.05 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  31.72 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  30.73 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  32.95 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 
298 aa  95.5  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  26.75 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  28.79 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  28.57 
 
 
302 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.37 
 
 
634 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  32.37 
 
 
290 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  28.51 
 
 
281 aa  93.2  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  34.2 
 
 
282 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  27 
 
 
517 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  31.21 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  31.79 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1569  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  28.71 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  29.61 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  31.62 
 
 
465 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  25.38 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  25.93 
 
 
650 aa  90.1  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  31.63 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>