211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3873 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3873  Metal-dependent hydrolase HDOD  100 
 
 		 316 aa  638    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.812708  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3872  Metal-dependent hydrolase HDOD  42.18 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  30.98 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  30.61 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25.5 
 
 		 280 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  29.11 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  30.54 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  26.48 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  26.94 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 		 544 aa  77  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.01 
 
 		 517 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  24.49 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  27.27 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  27.55 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  25.64 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  27.36 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  25.91 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  29.81 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  25.47 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  29.44 
 
 		 716 aa  70.1  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  25.85 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  29.31 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  21.77 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  28.06 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  25.78 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  25.47 
 
 		 415 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  27.41 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1012  putative signal transduction protein  27.6 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  25.13 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.63 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  24.87 
 
 		 912 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  24.64 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  24.27 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  25.98 
 
 		 730 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  29.23 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  24.63 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  24.2 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  24 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0298  hypothetical protein  24.6 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  24.51 
 
 		 650 aa  63.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  23.7 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  25.45 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  23.98 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  26.77 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  23.12 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  26.2 
 
 		 455 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.13 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.13 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  24.75 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  24.22 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  26.42 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25.13 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  23.9 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  26.73 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0247  hypothetical protein  24.6 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0275  hypothetical protein  24.6 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  26.11 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  23.66 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  23.85 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  25 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  21.2 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  27.89 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  25 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  25 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  27.94 
 
 		 718 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  23.5 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  27.03 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  24.19 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  22.63 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  21.46 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  28.02 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  23.88 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  29.25 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  19.91 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  23.41 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  21.03 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  21.03 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  22.58 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.37 
 
 		 634 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  24.23 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  23.69 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  28.65 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  35.16 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2713  putative signal transduction protein  24.75 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  27.23 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  24.44 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>