291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1061 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  100 
 
 
271 aa  542  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  36.65 
 
 
278 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  36.99 
 
 
277 aa  171  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  36.3 
 
 
278 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  35.55 
 
 
273 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  35.93 
 
 
278 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  36.33 
 
 
287 aa  169  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  34.33 
 
 
278 aa  158  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  33.07 
 
 
430 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  31.48 
 
 
406 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  30.11 
 
 
270 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  31.68 
 
 
273 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  30.48 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  30.92 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  31.3 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  34.53 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  31.73 
 
 
268 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  34.87 
 
 
287 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  29.39 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 
283 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  34.5 
 
 
280 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  31.84 
 
 
280 aa  132  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  34.42 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  30.66 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  32.84 
 
 
280 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  33.66 
 
 
280 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  35.75 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  32.52 
 
 
413 aa  122  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  32.5 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  32.84 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  32.84 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  32.84 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  29.06 
 
 
278 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  33.17 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  33.17 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  33.17 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  33.17 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  26.55 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  29 
 
 
280 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  32.98 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  29.73 
 
 
410 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
283 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  28.37 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  27.97 
 
 
283 aa  96.3  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  25 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 
283 aa  95.5  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
399 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  26.61 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  27.4 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  28.87 
 
 
284 aa  92.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 
288 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  28.84 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  26.29 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
282 aa  89.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  27.05 
 
 
288 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  28.04 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
427 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  29.47 
 
 
299 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  28.23 
 
 
282 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 
282 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  27.59 
 
 
280 aa  85.5  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.6 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.39 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  29.65 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 
297 aa  82  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  29.81 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  28.5 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  32.39 
 
 
718 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2028  putative signal transduction protein  26.19 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  25.7 
 
 
282 aa  79  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  29.06 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  29.41 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  25.53 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  22.93 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  24.26 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  24.38 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  25.74 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  31.06 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  25.39 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  22.66 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  26.42 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  24.5 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  30.77 
 
 
724 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  30.28 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  25.98 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  24.5 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2515  putative signal transduction protein  29.81 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  26.56 
 
 
730 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  22.48 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  22.83 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  26.61 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  28.45 
 
 
544 aa  72.4  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  24.88 
 
 
289 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>