298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3473 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  100 
 
 
289 aa  585  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0432  putative signal transduction protein  45.99 
 
 
260 aa  215  7e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.299689  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  31.1 
 
 
280 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  31.2 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  36.02 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  34.47 
 
 
286 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  31.52 
 
 
280 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 
282 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  30.84 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  33.02 
 
 
287 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  29.38 
 
 
280 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 
280 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 
284 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  27.91 
 
 
274 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 
283 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  32.33 
 
 
373 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 
283 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 
287 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  29 
 
 
353 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  28.95 
 
 
369 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  29.86 
 
 
352 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 
544 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  26.98 
 
 
292 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 
340 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  24.45 
 
 
290 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  26.42 
 
 
275 aa  99.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  28.26 
 
 
302 aa  99  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30.8 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  29.41 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0714  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.63 
 
 
524 aa  95.5  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  29.59 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  29.65 
 
 
274 aa  94  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  25.78 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  28.9 
 
 
415 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  25.48 
 
 
289 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  27.94 
 
 
274 aa  92  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  27.94 
 
 
274 aa  92  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  27.94 
 
 
274 aa  92  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  27.01 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 
284 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  26.34 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  25.66 
 
 
287 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  28.37 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  28.37 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  28.37 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  26.27 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 
280 aa  89.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  28.37 
 
 
274 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  29.28 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0716  putative signal transduction protein  32.45 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.69 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  29.36 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  30.23 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  21.83 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  31.73 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 
407 aa  86.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  25.58 
 
 
718 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 
425 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  27.35 
 
 
351 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  25.97 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  21.61 
 
 
285 aa  87  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  29.8 
 
 
378 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.15 
 
 
300 aa  86.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 
291 aa  85.5  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  25 
 
 
496 aa  84.7  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2713  putative signal transduction protein  30.88 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.694333 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  27.19 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  28.71 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  29.86 
 
 
302 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  26.96 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  26.04 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  28.5 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  24.91 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  28.36 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  30.26 
 
 
290 aa  82  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
397 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  26.15 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  24.67 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  25.11 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  24.62 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  32.24 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  25.54 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  28.21 
 
 
730 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  26.7 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3372  metal dependent phosphohydrolase  23.48 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  22.5 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  24.51 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  25.2 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>