More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0899 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  100 
 
 		 297 aa  607  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  39.21 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0716  putative signal transduction protein  40.09 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  33.01 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0714  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.94 
 
 		 524 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  30.87 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  28.94 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  30.24 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  33.05 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  25.65 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  33.04 
 
 		 287 aa  99.4  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  30.63 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.82 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.85 
 
 		 517 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  24.77 
 
 		 292 aa  89.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  32.34 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  28.81 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 274 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 274 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 274 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  27.52 
 
 		 467 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  26.01 
 
 		 274 aa  85.5  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  28.87 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  27.52 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  24.65 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  27.19 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  27.51 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25.45 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.45 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.45 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  26.07 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  26.89 
 
 		 465 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  26.52 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.99 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  29.37 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  26.29 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  30.97 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  27.54 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  26.43 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  26.85 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  27.38 
 
 		 422 aa  79.7  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.91 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  33.8 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  26.75 
 
 		 724 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  25.85 
 
 		 468 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  25.55 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  26.89 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3720  putative signal transduction protein  26.09 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  26.83 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  29.36 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  27.5 
 
 		 716 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25.45 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  24.3 
 
 		 718 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  29.02 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  24.55 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  29.11 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  26.09 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  28.7 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  26.83 
 
 		 469 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  26.47 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  25.46 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  28.05 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  25.56 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  27.66 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  27.98 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  28.21 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  29.95 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  26.89 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  28.04 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2713  putative signal transduction protein  26.27 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  27.55 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  20.75 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  27.19 
 
 		 730 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  24.89 
 
 		 456 aa  72.8  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1012  putative signal transduction protein  27.31 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  25.53 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  28.35 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  26.85 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  25.6 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  26.38 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0866  Metal-dependent hydrolase HDOD  24.31 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  30.28 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  25.31 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>