282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1703 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  100 
 
 		 326 aa  661    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  39.21 
 
 		 297 aa  190  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  37.44 
 
 		 280 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0714  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.74 
 
 		 524 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  27.31 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  36.02 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  32.37 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  29 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  33.19 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  28.77 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 		 286 aa  99.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  34.54 
 
 		 290 aa  99.4  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  28.11 
 
 		 274 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  28.11 
 
 		 274 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0716  putative signal transduction protein  32.51 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  28.31 
 
 		 274 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  27.72 
 
 		 274 aa  95.9  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  27.27 
 
 		 277 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 		 284 aa  93.6  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 505 aa  92.8  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  28.42 
 
 		 284 aa  92.4  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  27.19 
 
 		 274 aa  92.4  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  28.21 
 
 		 281 aa  92.4  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  27.19 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  27.19 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  28.25 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  27.19 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  27.11 
 
 		 279 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  25.43 
 
 		 284 aa  89.7  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  30.86 
 
 		 287 aa  89.4  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  29.11 
 
 		 289 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  26.52 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  28.82 
 
 		 275 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  32.02 
 
 		 281 aa  87  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  32.86 
 
 		 369 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  28.63 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.79 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 		 283 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 		 298 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  28.9 
 
 		 351 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 		 279 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  26.41 
 
 		 291 aa  85.9  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 		 297 aa  85.9  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 		 280 aa  85.9  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0432  putative signal transduction protein  32.08 
 
 		 260 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.299689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  27.16 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  23.56 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.53 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  31.12 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  26.21 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  31.89 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  27.15 
 
 		 730 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  27.15 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  26.91 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  25.39 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  28.48 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  29.33 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  26.04 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  24.34 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3372  metal dependent phosphohydrolase  24.01 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  25.89 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  25.11 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  25.74 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  24.91 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  28.81 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  25.09 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  26.24 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30.18 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  25.7 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  29.02 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  25.55 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  30.5 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  27.09 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  27.35 
 
 		 468 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  25.28 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  27.57 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  22.99 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  27.69 
 
 		 716 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  23.24 
 
 		 718 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  25.85 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  28.45 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  29.06 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>