More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2063 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  100 
 
 		 284 aa  577  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  81.56 
 
 		 284 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  68.57 
 
 		 284 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  65.36 
 
 		 280 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  65.11 
 
 		 284 aa  374  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  36.36 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  37.78 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  36.15 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  36.03 
 
 		 280 aa  185  9e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  35.06 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  34.78 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 		 289 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  31.09 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 		 291 aa  158  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 		 455 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  30.28 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  34.96 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  35.77 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  31.99 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  32.6 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  30.08 
 
 		 303 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  33.22 
 
 		 284 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 		 407 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 		 299 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  30.65 
 
 		 351 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  33.19 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 		 353 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  33.76 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  35.34 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  30.4 
 
 		 412 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  31.16 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 		 425 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  31.8 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  30.55 
 
 		 282 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 397 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  36.19 
 
 		 378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 		 397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  28.52 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25.95 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  31.6 
 
 		 517 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  31.28 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  29.64 
 
 		 340 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  34.96 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  30.4 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  33.49 
 
 		 718 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  29.43 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.49 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  34.18 
 
 		 505 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  30.35 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  29.46 
 
 		 716 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  30.21 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  29.32 
 
 		 358 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  29.07 
 
 		 415 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  29.78 
 
 		 730 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  30.94 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 509 aa  97.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  30.77 
 
 		 724 aa  96.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  26.72 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  27.71 
 
 		 912 aa  95.9  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  31.66 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  26.3 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  29.15 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  31.47 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  28.42 
 
 		 326 aa  92.4  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  27.86 
 
 		 290 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  32.26 
 
 		 274 aa  92.4  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  31.75 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  28.52 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  31.75 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  31.75 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3372  metal dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  28.2 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  27.86 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 		 427 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  32.2 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  31.22 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  25.37 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  31.16 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  25.09 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  26.45 
 
 		 275 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.83 
 
 		 634 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>