More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1202 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  100 
 
 		 292 aa  604  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  41.24 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  33.6 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  31.09 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  31.34 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  29.43 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 		 397 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  31.84 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  28.83 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  31.8 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  30.8 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  28.01 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  28.68 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  29.39 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  24.14 
 
 		 496 aa  104  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  31.06 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  33.89 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  30.21 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  27.43 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  26.97 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 425 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 		 353 aa  99  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 		 544 aa  98.6  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  27.43 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  28.63 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 378 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  26.59 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  24.73 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 		 282 aa  96.3  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  28.1 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  28.94 
 
 		 303 aa  95.9  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  30.54 
 
 		 351 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 		 284 aa  95.5  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  26.29 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  27.38 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  31.92 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  29.39 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 		 289 aa  92.8  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  29.29 
 
 		 438 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  26.04 
 
 		 407 aa  91.3  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  28.4 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  30.81 
 
 		 373 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 		 427 aa  89.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  24.77 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  31.55 
 
 		 352 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 282 aa  89.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25.31 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 284 aa  89  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  31.36 
 
 		 275 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  28.5 
 
 		 650 aa  86.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  29.36 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  30.05 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  29.61 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  27.31 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  27.31 
 
 		 730 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  26.15 
 
 		 912 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  28.14 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  28.08 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  31.34 
 
 		 505 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  28.14 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  28.18 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  27.54 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  27.48 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  32.37 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3372  metal dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  28.08 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  28.08 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  28.16 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  26.24 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 		 397 aa  79  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  24.59 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  29.1 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  28.5 
 
 		 718 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  26.91 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  26.73 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  25.18 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  26.73 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  26.73 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  26.73 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>