More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0281 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
284 aa  573  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  68.57 
 
 
284 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  65.37 
 
 
284 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  62.5 
 
 
280 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  60.43 
 
 
284 aa  345  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  38.77 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  40.08 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  37.64 
 
 
274 aa  199  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 
279 aa  191  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  35.84 
 
 
280 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  30.45 
 
 
289 aa  165  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  30.68 
 
 
287 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 
286 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 
297 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  29.81 
 
 
291 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 
297 aa  148  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  29.43 
 
 
283 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  29.43 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  32.75 
 
 
304 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.21 
 
 
298 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  27.24 
 
 
289 aa  142  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  28.94 
 
 
300 aa  142  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  29.96 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 
397 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  31.94 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  29.52 
 
 
455 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  30.54 
 
 
299 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 
299 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25.63 
 
 
297 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  32.48 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 
284 aa  126  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  29.77 
 
 
353 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  33.21 
 
 
352 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  30.15 
 
 
297 aa  122  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  27.41 
 
 
351 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 
412 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  27.38 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  31.5 
 
 
369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  31.46 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  34.18 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  32 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  33.46 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.43 
 
 
517 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 
408 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 
340 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 
425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 
285 aa  109  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.17 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  30.28 
 
 
716 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 
285 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 
292 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  30.8 
 
 
397 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 
285 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  29 
 
 
287 aa  106  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  33.33 
 
 
302 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  31.06 
 
 
292 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  23.62 
 
 
305 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 
412 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  28.21 
 
 
912 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  28.25 
 
 
373 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  26.39 
 
 
293 aa  99.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  31.02 
 
 
358 aa  99  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  31.66 
 
 
509 aa  97.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  27.64 
 
 
275 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 
290 aa  94  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  31.55 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  28.87 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  27.11 
 
 
505 aa  92.8  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  26.36 
 
 
730 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  26.97 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  29.44 
 
 
290 aa  90.1  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  27.78 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  27.19 
 
 
275 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  26.72 
 
 
280 aa  89.7  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 
282 aa  89  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  25.56 
 
 
456 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  28.26 
 
 
415 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  31.07 
 
 
512 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  29.15 
 
 
718 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  29.63 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  27.01 
 
 
289 aa  87  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  29.06 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  25.33 
 
 
274 aa  85.9  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 
283 aa  86.3  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  24.31 
 
 
467 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  27.38 
 
 
280 aa  85.9  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  29.06 
 
 
285 aa  85.5  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
288 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  29.63 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  26 
 
 
724 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  24.31 
 
 
467 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>