More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1044 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  40.3 
 
 		 282 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  36.04 
 
 		 283 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  35.46 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  35.94 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  33.69 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  37.79 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  33.33 
 
 		 280 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  29.56 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 		 397 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  33.84 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  29.31 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  29.15 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  30.69 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  30.2 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  30.2 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  30 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  26.99 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  29.7 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  28.14 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 		 397 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  27 
 
 		 304 aa  99.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  28.82 
 
 		 287 aa  99.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  27.63 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  27.63 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  31.48 
 
 		 281 aa  95.9  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  28.11 
 
 		 274 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  28.11 
 
 		 274 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  28.11 
 
 		 274 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  27.65 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  28.11 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  27.65 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  27.12 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  25.54 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  26.3 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 		 286 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  23.47 
 
 		 289 aa  92.8  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 		 544 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  26.97 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  32.76 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  26.4 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.91 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  24.54 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  27.1 
 
 		 291 aa  89  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  27.6 
 
 		 438 aa  89  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.81 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  30.05 
 
 		 274 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  26.32 
 
 		 277 aa  87.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 		 412 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 		 340 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  28.95 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.41 
 
 		 517 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  25.55 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  26.82 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  26.24 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  26.25 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  28.43 
 
 		 718 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  28.76 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1784  putative signal transduction protein  26.43 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  28.92 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  21.4 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  28.06 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  22.66 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  23.89 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  28.14 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  24.44 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.14 
 
 		 642 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  24.43 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25.45 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 703 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  26.04 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  25 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3873  Metal-dependent hydrolase HDOD  26.94 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.812708  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  26.18 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1582  thiamine-phosphate kinase  26.67 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  26.89 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  23.98 
 
 		 455 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  28.89 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>