More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0769 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  70.65 
 
 
279 aa  431  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  68.1 
 
 
280 aa  411  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  61.4 
 
 
274 aa  362  3e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  36.15 
 
 
284 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 
284 aa  191  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 
280 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 
284 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 
284 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  33.96 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
407 aa  156  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  32.22 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  34.44 
 
 
352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  32.53 
 
 
286 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  29.86 
 
 
297 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 
299 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  28.92 
 
 
289 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
299 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
353 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  30.56 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  31.98 
 
 
298 aa  135  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  27.61 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 
412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 
297 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  31.56 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  31.32 
 
 
425 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 
290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  30.45 
 
 
351 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  32.53 
 
 
287 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  29.2 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 
378 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  26.2 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  29.54 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  32.06 
 
 
283 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
283 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 
455 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  31.46 
 
 
280 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  30.14 
 
 
282 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 
397 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 
297 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  27.44 
 
 
305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  27.61 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  26.55 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  29.62 
 
 
369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 
412 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
408 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  31.84 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  30.8 
 
 
427 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  32.93 
 
 
358 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  29.66 
 
 
373 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  31.29 
 
 
340 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  27.99 
 
 
291 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  28.26 
 
 
274 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  30.32 
 
 
274 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  28.26 
 
 
274 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  28.26 
 
 
274 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 
297 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  31.2 
 
 
397 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  29.33 
 
 
304 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  29.19 
 
 
302 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  31.17 
 
 
299 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  28.37 
 
 
274 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 
280 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.54 
 
 
290 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  31.34 
 
 
275 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  26.07 
 
 
287 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  27.06 
 
 
277 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  26.38 
 
 
275 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  30.46 
 
 
292 aa  99.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  27.64 
 
 
415 aa  98.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  29.7 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  27.17 
 
 
468 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  28.93 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  28.43 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  27.78 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  27.62 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  28.28 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  27.96 
 
 
274 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  27.96 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  27.96 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 
288 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  25.11 
 
 
730 aa  95.5  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  26.17 
 
 
313 aa  95.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  23.02 
 
 
288 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  27.85 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  27.46 
 
 
466 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  27.49 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  27.37 
 
 
716 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  24.88 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  26.28 
 
 
467 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  28.29 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>