More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1400 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  100 
 
 		 373 aa  755    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  46.8 
 
 		 369 aa  212  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  37.18 
 
 		 378 aa  193  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  35.98 
 
 		 287 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  35.98 
 
 		 283 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  38.96 
 
 		 455 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  35.56 
 
 		 289 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 		 291 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 		 407 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  33.83 
 
 		 353 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  31.68 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 		 289 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  37.55 
 
 		 286 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  34.32 
 
 		 425 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  35.66 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  40.8 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 		 397 aa  153  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  36.94 
 
 		 291 aa  146  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  30.49 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  32.47 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  30.89 
 
 		 280 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  32.49 
 
 		 281 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  37.25 
 
 		 287 aa  123  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  30.66 
 
 		 279 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  28.63 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  31.28 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  33 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  29.48 
 
 		 280 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 		 285 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  35.69 
 
 		 282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  27.56 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  29.92 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  27.9 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  33.18 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  27.47 
 
 		 283 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  26.94 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  28.62 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  30.49 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  30.98 
 
 		 280 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  34.51 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  30.04 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.03 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 		 544 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  32.11 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  29.76 
 
 		 650 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  27.39 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  28.06 
 
 		 287 aa  99.8  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  30.57 
 
 		 283 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  26.19 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  32.58 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  28.19 
 
 		 280 aa  97.8  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  27.55 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  30 
 
 		 292 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.9 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  24.68 
 
 		 282 aa  97.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  28.03 
 
 		 303 aa  97.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  29.23 
 
 		 289 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  29.52 
 
 		 718 aa  96.7  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  29.56 
 
 		 284 aa  96.7  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 		 297 aa  96.7  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 297 aa  96.3  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 		 293 aa  95.9  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  30.33 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 		 284 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  25.54 
 
 		 290 aa  95.1  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  28.14 
 
 		 281 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  29.86 
 
 		 290 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  27.92 
 
 		 505 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  23.48 
 
 		 305 aa  92.8  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  27.27 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  27.75 
 
 		 288 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  29.19 
 
 		 290 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.09 
 
 		 284 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  31.55 
 
 		 275 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  30.33 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  30.88 
 
 		 275 aa  90.5  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 		 412 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  28.12 
 
 		 275 aa  89.7  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  28.02 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 		 440 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  26.4 
 
 		 280 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0432  putative signal transduction protein  30.36 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.299689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  30.66 
 
 		 302 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 		 427 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  27.78 
 
 		 274 aa  86.3  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  28.35 
 
 		 517 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  34.43 
 
 		 293 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>