273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0432 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0432  putative signal transduction protein  100 
 
 
260 aa  528  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.299689  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  45.99 
 
 
289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  30.68 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 
297 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 
287 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  27.01 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  34.98 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  32.86 
 
 
369 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  31.32 
 
 
291 aa  92  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  33.95 
 
 
378 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  36.53 
 
 
280 aa  89.4  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  29.24 
 
 
280 aa  88.6  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3372  metal dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  27.71 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  33.53 
 
 
352 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  34.22 
 
 
290 aa  87  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  34.46 
 
 
415 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 
282 aa  85.9  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  32.08 
 
 
326 aa  85.5  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.53 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.88 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  29.91 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  30.16 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  28.12 
 
 
351 aa  82  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  31.9 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.09 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  28.57 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  29.86 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  33.89 
 
 
280 aa  79  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.06 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  30.48 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  25.39 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  26.94 
 
 
438 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  33.54 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 
397 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
544 aa  75.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  29.47 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  31.6 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  27.84 
 
 
718 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  32.12 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  31.41 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  28.66 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  31.72 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  30.1 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  24.56 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  28.18 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0714  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.08 
 
 
524 aa  72  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 
703 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  28.34 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  27.13 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  31.11 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  22.27 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  32.84 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  25.95 
 
 
505 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 
412 aa  68.9  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  26.25 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  26.29 
 
 
496 aa  68.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  29.03 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  30.36 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  28.08 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  22.62 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  26.63 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.84 
 
 
632 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  27.22 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  29.35 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  29.35 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  29.35 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  30.73 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  29.35 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  27.75 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  23.46 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  28.49 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  24.05 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  28.25 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.14 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  27.87 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  27.87 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  26.4 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  27.18 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  28.74 
 
 
634 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  29.21 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  25.89 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>