More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02425 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  100 
 
 		 281 aa  577  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  51.25 
 
 		 281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  37.81 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  38.71 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  31.7 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  31.25 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  30.94 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  32.02 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  36.95 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  30.34 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 		 455 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 		 407 aa  132  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  34.22 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  32.69 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 		 408 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 		 425 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  31.44 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  31.44 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  32.67 
 
 		 415 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  32.49 
 
 		 373 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  29.15 
 
 		 351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 		 353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  29.27 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  30.1 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  32.46 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 		 397 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  26.59 
 
 		 718 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  28.04 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  30.17 
 
 		 422 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  26.62 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03213  hypothetical protein  36.36 
 
 		 161 aa  96.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000858892  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  31 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.85 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  28.43 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  25.74 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  28.28 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  25.36 
 
 		 283 aa  92.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  25.12 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  29.47 
 
 		 302 aa  89  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  24.81 
 
 		 275 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  28.92 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  30.3 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.96 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  27.86 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  22.93 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  27.86 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  27.86 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  32.02 
 
 		 326 aa  87  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  25.69 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  25.84 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  27.36 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  26.25 
 
 		 456 aa  85.9  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  28.29 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  22.46 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25.65 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  30.77 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  32.24 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.65 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.65 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  25.65 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.47 
 
 		 634 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  28.51 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  27.23 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  32.54 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  26.4 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  28.29 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  26.14 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  27.09 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  27.49 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  28.5 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  26.97 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  29.63 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  27.7 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  26.79 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  28.16 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  24.54 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  25.24 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  27.49 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  29.1 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>