256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4397 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  100 
 
 
422 aa  871    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  38.33 
 
 
469 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  37.35 
 
 
466 aa  293  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  37.26 
 
 
468 aa  292  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  35.94 
 
 
465 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  37.44 
 
 
469 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  35.8 
 
 
465 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  35.06 
 
 
467 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  35.31 
 
 
467 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  35.31 
 
 
467 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  35.14 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  36.13 
 
 
456 aa  270  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3720  putative signal transduction protein  35.31 
 
 
464 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48460  signal transduction protein  33.91 
 
 
373 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  27.7 
 
 
456 aa  149  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  28.74 
 
 
283 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  30.17 
 
 
281 aa  97.8  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  32.47 
 
 
281 aa  96.7  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3043  putative signal transduction protein  31.47 
 
 
276 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  28.14 
 
 
283 aa  94.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  26.64 
 
 
281 aa  92.8  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 
297 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  28.91 
 
 
290 aa  92  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  28 
 
 
517 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  27.01 
 
 
650 aa  90.5  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  30.22 
 
 
716 aa  89.7  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
279 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  26.57 
 
 
279 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
455 aa  87  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
408 aa  87  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1053  diguanylate cyclase  27.66 
 
 
519 aa  87  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  24.73 
 
 
280 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.9 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
286 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  28.51 
 
 
292 aa  84  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  28.87 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  26.89 
 
 
285 aa  82.4  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  26.39 
 
 
280 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  23.83 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  24.3 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.4 
 
 
634 aa  80.1  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  24.12 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  27.38 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  28.02 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  26.5 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  23.71 
 
 
425 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.24 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  23.71 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  25.47 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  27.7 
 
 
305 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  27.88 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  29.73 
 
 
352 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  25.58 
 
 
284 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.92 
 
 
642 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  25.1 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  25.91 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  25.85 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  26.78 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  25.89 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  27.57 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  29.56 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  26.99 
 
 
730 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  25.7 
 
 
790 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  27.23 
 
 
718 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  22.88 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  25.34 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  27.65 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  26.07 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3372  metal dependent phosphohydrolase  25.42 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  25.71 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  24.15 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  26.07 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 
544 aa  70.1  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  25.59 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0287  hypothetical protein  26.02 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  27.1 
 
 
278 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  20.91 
 
 
276 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  29.05 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  25.39 
 
 
505 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1977  putative signal transduction protein  28.71 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  23.19 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  30.29 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  23.21 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  23.53 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.76 
 
 
696 aa  66.6  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  24.22 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  24.22 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  27.23 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  24.22 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>