263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0641 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  100 
 
 
456 aa  925    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  47.62 
 
 
469 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  47.6 
 
 
469 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  44 
 
 
468 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  43.25 
 
 
467 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  44.05 
 
 
465 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  43.61 
 
 
465 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  42.95 
 
 
467 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  43.82 
 
 
466 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  42.79 
 
 
467 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  42.56 
 
 
467 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3720  putative signal transduction protein  39.68 
 
 
464 aa  325  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  36.13 
 
 
422 aa  270  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48460  signal transduction protein  40.77 
 
 
373 aa  210  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  28.24 
 
 
456 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  26.79 
 
 
650 aa  93.2  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.76 
 
 
517 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3043  putative signal transduction protein  33.78 
 
 
276 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25.56 
 
 
280 aa  87.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  29.63 
 
 
281 aa  86.3  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  29.17 
 
 
305 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  27.78 
 
 
281 aa  84  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  25.6 
 
 
505 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.09 
 
 
632 aa  80.5  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  25.65 
 
 
290 aa  77  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  26.64 
 
 
278 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  26.34 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  23.4 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  27.31 
 
 
509 aa  73.2  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  23.38 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  23.58 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  24.89 
 
 
297 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  24.14 
 
 
496 aa  73.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  28.77 
 
 
279 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  24.15 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  23.04 
 
 
283 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  26.67 
 
 
274 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  26.67 
 
 
274 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 
283 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  26.67 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  24.76 
 
 
642 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0866  Metal-dependent hydrolase HDOD  25.12 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  29.36 
 
 
280 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  24.91 
 
 
277 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  22.93 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  26.11 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  25.89 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  25.89 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  27.91 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  25.89 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  25.89 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  23.91 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  24.16 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  29.48 
 
 
512 aa  69.7  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  23.89 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  25 
 
 
280 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  25.26 
 
 
281 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.07 
 
 
634 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  25.25 
 
 
290 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 
282 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  27.23 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  24.22 
 
 
275 aa  68.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  29.56 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  25.89 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  28.14 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  22.88 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  27.89 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  25.82 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2001  HDOD domain-contain protein  26.22 
 
 
272 aa  67  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  25.71 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  26.79 
 
 
326 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  22.03 
 
 
284 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  26.6 
 
 
282 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  25.76 
 
 
289 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1569  putative signal transduction protein  25.82 
 
 
283 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  26.2 
 
 
297 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  31.12 
 
 
275 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0544  putative signal transduction protein  25.23 
 
 
265 aa  65.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  27.35 
 
 
290 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 
285 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  24.14 
 
 
292 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  22.14 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1582  thiamine-phosphate kinase  27.31 
 
 
272 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  25.12 
 
 
351 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  27.52 
 
 
288 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  26.98 
 
 
275 aa  64.7  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  22.86 
 
 
284 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  27.92 
 
 
415 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  25.84 
 
 
292 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>