277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0980 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  100 
 
 
275 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  86.23 
 
 
276 aa  497  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  52.47 
 
 
282 aa  287  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2028  putative signal transduction protein  51.29 
 
 
279 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  53.3 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  41.3 
 
 
282 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  40.38 
 
 
282 aa  211  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  38.79 
 
 
285 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  38.43 
 
 
285 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  35.45 
 
 
283 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  36.51 
 
 
281 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 
298 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 
299 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 
300 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1838  metal dependent phosphohydrolase  32.69 
 
 
395 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1923  metal dependent phosphohydrolase  32.69 
 
 
395 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 
299 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  28.69 
 
 
280 aa  99  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  28.36 
 
 
283 aa  99  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  28.39 
 
 
297 aa  99  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.08 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  28.36 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  27.94 
 
 
303 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 
297 aa  95.9  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  32.2 
 
 
397 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  32.33 
 
 
378 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 
297 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 
397 aa  92.8  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  28.47 
 
 
302 aa  92.4  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 
412 aa  91.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 
397 aa  89.7  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  30.77 
 
 
718 aa  89.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  31.82 
 
 
288 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
288 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.56 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  29.3 
 
 
369 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  28.04 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 
291 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  28.94 
 
 
288 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
406 aa  86.3  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  28.93 
 
 
284 aa  85.9  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  27.67 
 
 
278 aa  85.9  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 
292 aa  85.9  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  29.8 
 
 
544 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
384 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  30.19 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  29.2 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  27.95 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  27.8 
 
 
277 aa  82  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  34.13 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 
287 aa  82  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  29.22 
 
 
287 aa  82  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  30 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 
455 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  25.17 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  27.97 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.87 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  28.19 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  29.93 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  29.93 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  29.93 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 
407 aa  75.9  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  30.61 
 
 
408 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  30.61 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  30.61 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  30.61 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  25.48 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  30.61 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  28.85 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  26.77 
 
 
716 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  29.76 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  31.29 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  31.29 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  29.93 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  31.36 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  28.23 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  25.57 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  27.48 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  25.79 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  28.73 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  31.29 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>