More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2207 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  100 
 
 		 281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2488  putative signal transduction protein  52.38 
 
 		 275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3043  putative signal transduction protein  38.81 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211419  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  29.92 
 
 		 456 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  27.62 
 
 		 517 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  29.55 
 
 		 469 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  29.18 
 
 		 469 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  28.57 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.91 
 
 		 632 aa  95.9  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  28.4 
 
 		 465 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  28.4 
 
 		 465 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 		 544 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  26.64 
 
 		 422 aa  92.8  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  28.24 
 
 		 466 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  27.27 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 		 283 aa  92.4  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  28.78 
 
 		 468 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  29.47 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  28.02 
 
 		 467 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.85 
 
 		 642 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  28.68 
 
 		 467 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  28.67 
 
 		 289 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3720  putative signal transduction protein  29.36 
 
 		 464 aa  89  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  29.76 
 
 		 509 aa  89  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  28.64 
 
 		 275 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  32.2 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  27.63 
 
 		 467 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  31.13 
 
 		 378 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  25.89 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  27.63 
 
 		 467 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  28.09 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  29.63 
 
 		 456 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  30.54 
 
 		 292 aa  86.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.97 
 
 		 634 aa  85.9  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  26.29 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  27.68 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  26.55 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  29 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  29.21 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  28.57 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.29 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  26.78 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  24.38 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  26.47 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  28.11 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  27.8 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.32 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  22.15 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  24.4 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  29.65 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  28.5 
 
 		 650 aa  79.7  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 397 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  27.19 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  23.58 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  28.3 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.94 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  28.27 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  27.23 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  27.23 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  27.23 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  26.29 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  24.09 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  29 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  27.23 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  26.46 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  25.1 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  28.14 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  23.86 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  27.95 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  27.69 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  27.48 
 
 		 730 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  25.57 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  24.9 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  28.05 
 
 		 634 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  29.5 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  22.33 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  29.5 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  23.27 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  29.5 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  29.5 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  24.26 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  24.75 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  22.43 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  27 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  23.9 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  23.15 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  26.34 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  25 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  23.9 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  23.9 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>