246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3010 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  100 
 
 		 280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  76.79 
 
 		 280 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  75.71 
 
 		 280 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  75.71 
 
 		 280 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  75.71 
 
 		 280 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  75.71 
 
 		 280 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  75.36 
 
 		 280 aa  431  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  75.71 
 
 		 279 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  75.71 
 
 		 279 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  75.71 
 
 		 280 aa  425  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  74.64 
 
 		 279 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  75.36 
 
 		 280 aa  421  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  70 
 
 		 280 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  75.36 
 
 		 280 aa  418  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  72.86 
 
 		 280 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  74.9 
 
 		 250 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  39.78 
 
 		 278 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  40 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  38.35 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  34 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  38.57 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  34.8 
 
 		 278 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  34.4 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  32.16 
 
 		 273 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  34.53 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  32.83 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  33.48 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  30.08 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  30.08 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  30.08 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  31.14 
 
 		 273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  31.11 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  30.68 
 
 		 268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  32.54 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  31.84 
 
 		 430 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 		 409 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 406 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  26.56 
 
 		 399 aa  99  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0722  hypothetical protein  28.4 
 
 		 311 aa  89  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  28.29 
 
 		 410 aa  86.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  28.63 
 
 		 413 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  26.42 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  29.19 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  30.5 
 
 		 288 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003755  predicted signal transduction protein  25.88 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2035  hypothetical protein  27.85 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268391  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02629  hypothetical protein  25.88 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  28.27 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 544 aa  76.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  25.98 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  28.25 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  24.42 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  30.77 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  24.06 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  27.33 
 
 		 718 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  27.7 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  25.11 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  29.61 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  27 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.58 
 
 		 655 aa  72.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  29.63 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.15 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  30.2 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  23.67 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  27.04 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  25.68 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  29.02 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2511  putative signal transduction protein  27.6 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118204  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  26.47 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  28.48 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  28.48 
 
 		 730 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  29.93 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  27.69 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  24.68 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  23.62 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  28.88 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  26.11 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  24.12 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  24.76 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  23.62 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  23.62 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>