248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1964 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  100 
 
 		 413 aa  837    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  40.53 
 
 		 406 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  32.92 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  28.79 
 
 		 430 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  31.35 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  31.86 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  32.11 
 
 		 271 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  30.71 
 
 		 277 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  30.83 
 
 		 278 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 		 287 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  30.8 
 
 		 273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  31.3 
 
 		 278 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  31.71 
 
 		 278 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  31.47 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  28.63 
 
 		 270 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  28.63 
 
 		 270 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  31.31 
 
 		 280 aa  113  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  27.86 
 
 		 268 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  28.24 
 
 		 270 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  31.25 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  31.11 
 
 		 287 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  32.21 
 
 		 280 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  30.05 
 
 		 280 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  32.69 
 
 		 283 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  30.85 
 
 		 280 aa  101  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  30.73 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  30.48 
 
 		 279 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  30.24 
 
 		 280 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  30.24 
 
 		 280 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  30.24 
 
 		 280 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  30.24 
 
 		 280 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  29.27 
 
 		 280 aa  99.8  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  28.97 
 
 		 273 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  28 
 
 		 278 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 		 285 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  28.97 
 
 		 273 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  29.95 
 
 		 279 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  29.95 
 
 		 279 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  28 
 
 		 278 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  28.83 
 
 		 280 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  27.11 
 
 		 280 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  28.09 
 
 		 270 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 		 300 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 		 299 aa  90.1  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 		 299 aa  90.1  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  29 
 
 		 250 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 297 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 		 283 aa  87  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  28.68 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  29.72 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  32.41 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  27.39 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  27.39 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  26.52 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  24.62 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  36.76 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  28.63 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  28.15 
 
 		 298 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  25.93 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  26.97 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  23.66 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1053  diguanylate cyclase  29.59 
 
 		 519 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  22.22 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  21.85 
 
 		 276 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  23.45 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  28.86 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  33.58 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.82 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  31.25 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  23.01 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25.93 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  22.32 
 
 		 425 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 		 284 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  27.78 
 
 		 650 aa  66.6  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1992  putative signal transduction protein  26.21 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.880925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 		 282 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  25.59 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  25.17 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  24.14 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  23.21 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  23.27 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  28.67 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  22.66 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  32.65 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  29.17 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  30.71 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003755  predicted signal transduction protein  25.1 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  25.38 
 
 		 724 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  23.74 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3720  putative signal transduction protein  25 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  28.5 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  26.62 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  21.62 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.35 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 		 280 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>