270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0622 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  100 
 
 		 279 aa  566  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  46.53 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  41.54 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  40.39 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2511  putative signal transduction protein  31.69 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  30.49 
 
 		 287 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  28.34 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  28.34 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  31.11 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  28.37 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  30.09 
 
 		 399 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  29.29 
 
 		 430 aa  93.2  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  28.19 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  27.69 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  24.86 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  27.6 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  26.59 
 
 		 409 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  31.37 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  27.72 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  30.92 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  30.92 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  26.67 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  30.92 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  26.67 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  31.37 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  29.41 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  29.41 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  30.7 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  31.08 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  25.51 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  25.79 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  23.67 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  31.36 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  28.25 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  30.26 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  27.05 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  30.26 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  24.49 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  30.26 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  30.26 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  23.83 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  25.81 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  23.29 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  23.71 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  22.83 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  22.83 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  29.58 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  26.54 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  27.62 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  29.41 
 
 		 730 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  27.42 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  25.2 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  26.69 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  26.38 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  22.68 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  23.67 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  27.4 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  27.33 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.49 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  24.63 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  24.49 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  25.45 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  27.7 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  27.1 
 
 		 467 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  30.71 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  27.14 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  27.1 
 
 		 467 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  24.18 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  23.81 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  24.17 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  23.68 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  24.23 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  27.1 
 
 		 467 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 		 790 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  25.37 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  23.58 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25.35 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  27.27 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1053  diguanylate cyclase  29.35 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0011  putative signal transduction protein  27.34 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000072807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  25.32 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  27.1 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  24.89 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  25.99 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  24.11 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  27.44 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.33 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>