More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1462 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  83.45 
 
 		 278 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  83.09 
 
 		 278 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  62.23 
 
 		 278 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  60.65 
 
 		 273 aa  358  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  57.19 
 
 		 277 aa  340  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  56.32 
 
 		 273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  55.96 
 
 		 273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  57.09 
 
 		 270 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  56.34 
 
 		 270 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  56.34 
 
 		 270 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  55.97 
 
 		 268 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  42.97 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 		 406 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  39.22 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  37.44 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 430 aa  158  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  34.33 
 
 		 271 aa  158  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  36.86 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  35.74 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  38.82 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  34.87 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  35.8 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  36.08 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  34 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  37.25 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  37.25 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  36.36 
 
 		 280 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  37.5 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  37.5 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  37.5 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  37.5 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  35.12 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  36.2 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  30.45 
 
 		 409 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  29.62 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  30.28 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  32.23 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  29.18 
 
 		 270 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  32.87 
 
 		 399 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  30.42 
 
 		 410 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  31.47 
 
 		 413 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  31.11 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  31.52 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  29.19 
 
 		 299 aa  89  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  30.3 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2511  putative signal transduction protein  28.34 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  30.27 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  25.68 
 
 		 288 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  25.68 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  27.14 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  33.58 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  26.2 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  29.35 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 544 aa  79  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  24.28 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.95 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  25.94 
 
 		 718 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  30.67 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  23.5 
 
 		 425 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  26.57 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  26.04 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  27.12 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2035  hypothetical protein  25.93 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  23.9 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  28.27 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  26.47 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  25.26 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  25.89 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  26.4 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  26.74 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  25.53 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  22.01 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 		 455 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  27.49 
 
 		 468 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  26.83 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  27.96 
 
 		 724 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  25 
 
 		 730 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0704  hypothetical protein  26.67 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.670441  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  25.34 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  24.63 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  30.69 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  26.58 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  26.16 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  23.76 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25.77 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  24.63 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  25.1 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>