More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1965 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  100 
 
 		 399 aa  788    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 		 409 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  34.97 
 
 		 406 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  30.33 
 
 		 410 aa  142  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  29.26 
 
 		 430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  31.35 
 
 		 413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  29.96 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  35.58 
 
 		 278 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  35.1 
 
 		 278 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  27.84 
 
 		 273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  32.87 
 
 		 278 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  29.06 
 
 		 280 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  30.37 
 
 		 280 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  28.35 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  30.89 
 
 		 280 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  30.05 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  29.15 
 
 		 278 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  33.7 
 
 		 278 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  30.91 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  28.3 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  28.3 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  30.09 
 
 		 273 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  29.1 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  29.23 
 
 		 278 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  28.3 
 
 		 279 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  30.09 
 
 		 273 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  28.8 
 
 		 280 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 		 287 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  26.56 
 
 		 280 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  27.37 
 
 		 280 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  28.74 
 
 		 277 aa  97.8  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  27.37 
 
 		 280 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  27.37 
 
 		 280 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  27.37 
 
 		 280 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  31.46 
 
 		 289 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 		 282 aa  96.7  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  27.36 
 
 		 280 aa  96.7  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 271 aa  95.1  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  28.8 
 
 		 280 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  27.85 
 
 		 270 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  30.67 
 
 		 724 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  30.09 
 
 		 279 aa  93.6  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  27.85 
 
 		 270 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  33.18 
 
 		 275 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  27.43 
 
 		 270 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  27 
 
 		 268 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  28.31 
 
 		 283 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  31.31 
 
 		 278 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  27.76 
 
 		 288 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  27.76 
 
 		 288 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  29.57 
 
 		 274 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  26.56 
 
 		 303 aa  88.2  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  25.74 
 
 		 250 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 		 297 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  27.05 
 
 		 288 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  30.8 
 
 		 275 aa  86.7  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  31.91 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  28.44 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25.78 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  31.88 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.07 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  28.97 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  27.4 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  26.99 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  26.07 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.41 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  33.86 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0544  putative signal transduction protein  25.32 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25.91 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  30.54 
 
 		 279 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  26.94 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  23.84 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  30.35 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  23.64 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  29.85 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  29.85 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  29.85 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  26.96 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  29.85 
 
 		 274 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  25.64 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.1 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  28.95 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  28.81 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 		 544 aa  74.3  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  29.02 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2035  hypothetical protein  27.31 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268391  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  24.36 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  27.39 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0722  hypothetical protein  26.82 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  27.67 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  27.4 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  26.61 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>