134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0722 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0722  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003755  predicted signal transduction protein  70.26 
 
 		 306 aa  455  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02629  hypothetical protein  69.61 
 
 		 306 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2035  hypothetical protein  59.87 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268391  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  28.4 
 
 		 280 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  26.29 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  28.11 
 
 		 279 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  28.11 
 
 		 279 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  27.65 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  27.12 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  26.94 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  27.4 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  27.4 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  27.4 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  27.4 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  26.03 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  24.68 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  26.48 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  26.82 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  26.15 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  26.82 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  26.22 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  25.86 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  26.32 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  26.79 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  25.57 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  25.45 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2511  putative signal transduction protein  28.4 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  26.92 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  22.18 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  26.83 
 
 		 718 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  25.99 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  25.71 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  25.33 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  25.81 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  25.33 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  27.5 
 
 		 716 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2001  HDOD domain-contain protein  35.96 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0875  signal transduction protein  40.24 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0866  Metal-dependent hydrolase HDOD  36.14 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1582  thiamine-phosphate kinase  34.83 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  26.38 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  25.93 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  27.15 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  26.11 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  23.83 
 
 		 413 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  26.16 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  25.64 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  25.53 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  25.79 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  28.03 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  26.73 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1128  putative signal transduction protein  34.07 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 440 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  28.28 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  24.06 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  21.72 
 
 		 410 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  26.06 
 
 		 279 aa  52.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 324 aa  52.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  25.5 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  25.32 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  26.39 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  24.68 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  25.3 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  25.69 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2488  putative signal transduction protein  40.28 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  23.86 
 
 		 282 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  36.36 
 
 		 281 aa  49.7  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  30.07 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  36.49 
 
 		 480 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0600  response regulator  25.96 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  23.78 
 
 		 282 aa  49.3  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  21.32 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  28.12 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  23.72 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  27.01 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  27.01 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  33.33 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  25.45 
 
 		 352 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  36.71 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  21.94 
 
 		 346 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  26.63 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  27.88 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  23.75 
 
 		 287 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 		 293 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  26.63 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 		 298 aa  45.8  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  26.43 
 
 		 281 aa  45.8  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  24.31 
 
 		 284 aa  45.8  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  21.78 
 
 		 290 aa  45.8  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2726  putative signal transduction protein  31.63 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  29.27 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  23.27 
 
 		 488 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  22.28 
 
 		 488 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.58 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>