More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2726 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2726  putative signal transduction protein  100 
 
 		 365 aa  748    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3319  putative signal transduction protein  39.67 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02599  response regulator  36.36 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 412 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  30.95 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2368  putative signal transduction protein  32.92 
 
 		 403 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374822  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  39.85 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 		 449 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  39.1 
 
 		 456 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  39.32 
 
 		 438 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  38.17 
 
 		 451 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03496  response regulator  40.17 
 
 		 434 aa  92.8  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.74 
 
 		 473 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3800  response regulator receiver domain-containing protein  39.02 
 
 		 488 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2314  response regulator  40.77 
 
 		 475 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  40.77 
 
 		 475 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0599  response regulator  40.77 
 
 		 475 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1923  response regulator  40.77 
 
 		 475 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537818  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1662  response regulator  40.77 
 
 		 475 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0711  response regulator  40.77 
 
 		 518 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1716  response regulator  40.77 
 
 		 475 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 		 470 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5575  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5939  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2363  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 189 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3472  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 187 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1895  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 185 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.706146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1568  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 262 aa  86.3  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2541  response regulator  35.48 
 
 		 441 aa  86.3  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  33.08 
 
 		 447 aa  86.3  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0600  response regulator  23.5 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  40.31 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2538  response regulator  24.54 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.17 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1538  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  36.13 
 
 		 563 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.17 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0507  HupR response regulator  41.75 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00791251  normal  0.142838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 479 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2012  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 484 aa  82.8  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2539  response regulator  33.9 
 
 		 658 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 806 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2723  putative PAS/PAC sensor protein  38.33 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  37.01 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  33.33 
 
 		 965 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2709  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  29.9 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30830  putative two-component response regulator  43.1 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0592396  hitchhiker  0.000000000000489784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  40.34 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3364  hydrogenase accessory protein HypB  37.6 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3805  response regulator receiver domain-containing protein  31.06 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1465 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  36.13 
 
 		 560 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  36.22 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  36.22 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  36.22 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  36.22 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  36.22 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2645  response regulator  41.88 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0366662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  36.22 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0745  response regulator/HD domain-containing protein  36.22 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.04 
 
 		 994 aa  79.3  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3245  sigma 54-dependent DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  31.09 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26830  putative two-component response regulator  41.46 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  37.86 
 
 		 823 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1807  response regulator receiver protein  40 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1570  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2367  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.3 
 
 		 538 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.53 
 
 		 1355 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2371  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0784161  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  34.45 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0018  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.71 
 
 		 461 aa  75.9  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2289  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 135 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1340  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  24.22 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3109  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2273  putative two-component response regulator  38.62 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.438912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2721  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  36.75 
 
 		 1111 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  27.91 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2764  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4458  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  31.5 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2450  putative two-component response regulator  37.6 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3257  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.54 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5144  response regulator receiver protein  35 
 
 		 150 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 		 280 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  29.28 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  27.83 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0791  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC (Ornithine/argininedecarboxylase inhibitor)  33.88 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.261898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  35.29 
 
 		 516 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  23.04 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 507 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0049  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0605  response regulator  31.97 
 
 		 536 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1350  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00189482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>