More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2488 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2488  putative signal transduction protein  100 
 
 
275 aa  550  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  52.38 
 
 
281 aa  285  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3043  putative signal transduction protein  41.1 
 
 
276 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  31.6 
 
 
280 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  32.51 
 
 
280 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  29.82 
 
 
456 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.92 
 
 
632 aa  102  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 
340 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  30.4 
 
 
378 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  29.82 
 
 
517 aa  91.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  27.72 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  31.82 
 
 
465 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  32.69 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  30.39 
 
 
297 aa  90.1  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  28.7 
 
 
274 aa  89.7  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 
297 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  31.19 
 
 
465 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  28.91 
 
 
287 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  31.09 
 
 
634 aa  87  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  27.19 
 
 
299 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  29.91 
 
 
467 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  29.02 
 
 
468 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  29.72 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  26.5 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  30.33 
 
 
505 aa  86.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  34.72 
 
 
397 aa  85.9  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.87 
 
 
303 aa  85.5  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  29.91 
 
 
467 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.07 
 
 
634 aa  85.5  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 
299 aa  85.5  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  29.46 
 
 
467 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  30.23 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  29.46 
 
 
467 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  24.75 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  29.63 
 
 
466 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  28.79 
 
 
415 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0875  signal transduction protein  27.59 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0319  two component diguanylate cyclase  32.16 
 
 
661 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  26.91 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  31.96 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 
300 aa  82  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  26.23 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  25.54 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  27.39 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  28.44 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.83 
 
 
642 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  27.08 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  23.81 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  26.2 
 
 
422 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  26.5 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  28 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  26.83 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  29.55 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  25.79 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  28.14 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1992  putative signal transduction protein  28.39 
 
 
287 aa  79  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.880925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  25.11 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  26.64 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  26.64 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  28.51 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  26.64 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  27.27 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  26.64 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
544 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  25.79 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  26.09 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  27.75 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  26.77 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  26.96 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  26.19 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  26.63 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  26.98 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 
412 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  26.38 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  27.78 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  27.92 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  25.79 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  26.67 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  26.67 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  26.63 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  24.49 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3720  putative signal transduction protein  26.58 
 
 
464 aa  75.5  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  29.59 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  26.77 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  24.59 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  26.96 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  26.96 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  28.84 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  24.29 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  26.96 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>