259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0875 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0875  signal transduction protein  100 
 
 		 283 aa  578  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  37.06 
 
 		 288 aa  175  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  36.14 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  34.19 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  34.04 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  34.49 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  34.02 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  34.15 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  33.92 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  31.64 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  32.07 
 
 		 281 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3312  hypothetical protein  31.65 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  33.21 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  34 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0413  hypothetical protein  31.85 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  30.94 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0704  hypothetical protein  29.06 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.670441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  29.84 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1494  putative signal transduction protein  28.71 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000467466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  26.89 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  26.32 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  30.9 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  27.69 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  30.89 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  28.8 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  30.5 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  27.62 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  25.87 
 
 		 718 aa  80.5  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  29.69 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  29.17 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  27.89 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  26.94 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  26.94 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  27.5 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  26.94 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  26.94 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  26.7 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  26.7 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.74 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  23.59 
 
 		 378 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  26.9 
 
 		 716 aa  72  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  26.7 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  27.22 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.5 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  27.43 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2488  putative signal transduction protein  27.72 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  29.61 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  24.5 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  25.13 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  30.05 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1784  putative signal transduction protein  24.11 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  26.94 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  25.59 
 
 		 724 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.78 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  28.32 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  24.54 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  26.57 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  25.33 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  25.73 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2008  putative signal transduction protein  27.54 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218078 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  25.83 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  29.55 
 
 		 912 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  22.07 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  23.79 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  24.51 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  28.37 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  25.35 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  27.62 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.74 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  26.62 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  26.92 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  25.62 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  25.52 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3688  putative signal transduction protein  25.4 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1053  diguanylate cyclase  28.64 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  26.78 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  21.49 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  24.07 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.75 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  21.72 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  29.35 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0312  putative signal transduction protein  26.04 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  25.89 
 
 		 730 aa  63.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  25.97 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  23.73 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  23.71 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  23.74 
 
 		 440 aa  62.4  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>