297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1512 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  100 
 
 		 293 aa  587  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  38.52 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  37.37 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  37.81 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  37.81 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  37.37 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  38.2 
 
 		 274 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  38.49 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  34.3 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  34.52 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  32.6 
 
 		 288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  35.66 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  34.35 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  33.46 
 
 		 281 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0413  hypothetical protein  35.6 
 
 		 254 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  35.66 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0704  hypothetical protein  29.04 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.670441  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0875  signal transduction protein  30.94 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2008  putative signal transduction protein  32.83 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3312  hypothetical protein  28.87 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  34 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  30.52 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  26.89 
 
 		 351 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  34.02 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  28.36 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  30.26 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  29.11 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  30.08 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  31.12 
 
 		 397 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1784  putative signal transduction protein  27.57 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  28.5 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  30.05 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  30.43 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  29.59 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 		 425 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  28.4 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  31.5 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.21 
 
 		 412 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.88 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  34.43 
 
 		 373 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  29.08 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  30.1 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  31.47 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  31.03 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  29.26 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 		 371 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  24.21 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.85 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  26.96 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  29.34 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  28.87 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  27.11 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  30.14 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  24.72 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  26.55 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1494  putative signal transduction protein  25.25 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000467466  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  26 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  31.82 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  30.68 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 		 544 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  28.18 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.86 
 
 		 632 aa  69.7  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  25.28 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  26.5 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  29.82 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  30.46 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3688  putative signal transduction protein  31.12 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  24.91 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  27.5 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  27.62 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  24.64 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0312  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  28.23 
 
 		 912 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  23.98 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  26.18 
 
 		 716 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  25 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  26.47 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1992  putative signal transduction protein  28.1 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.880925  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  26.44 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  29.57 
 
 		 634 aa  66.2  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  26.74 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>