239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0704 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0704  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  576  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.670441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  35.37 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  29.04 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  34.06 
 
 		 292 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  33.19 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  32.89 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  30.9 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  28.68 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  32.92 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  30.9 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  31.44 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  30.04 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  32.23 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  24.91 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  29.41 
 
 		 292 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0413  hypothetical protein  31.88 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  27.21 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0875  signal transduction protein  29.06 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3312  hypothetical protein  25.38 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0312  putative signal transduction protein  30.26 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1494  putative signal transduction protein  27.51 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000467466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  22.5 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  21.95 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  22.69 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  26.7 
 
 		 351 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  25.44 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  23.53 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  25.96 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  26.21 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  28.02 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  26.63 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  25.53 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  26.5 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 		 412 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  18.8 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1992  putative signal transduction protein  25.37 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.880925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  25.7 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  25.1 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  21.33 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  28.14 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.64 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  28.14 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  26.6 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  24.43 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  24.9 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  22.81 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.01 
 
 		 517 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  25.09 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  23.28 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  19.66 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  25.63 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  20.1 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3688  putative signal transduction protein  26.54 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  25.24 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  26.63 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  25.12 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  23.47 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  27.18 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  22.89 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  23.47 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  25.48 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  25.94 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  23.53 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  23.75 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  25.91 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  26.16 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  24.1 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  23.74 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2008  putative signal transduction protein  23.02 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  23.47 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  24.49 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  24.77 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  28.14 
 
 		 415 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.94 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.94 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25.94 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  25.49 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  22.63 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  23.87 
 
 		 632 aa  65.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  23.78 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  24.74 
 
 		 407 aa  65.9  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  24.51 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  26.05 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  22.63 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  25.25 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  24.74 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  23.02 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  22.99 
 
 		 650 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  22.01 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  25.99 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  25.69 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  21.54 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1388  putative signal transduction protein  23.87 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  24.88 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  23.88 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>