286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2268 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  100 
 
 
277 aa  566  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  58.27 
 
 
278 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  57.91 
 
 
278 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  57.91 
 
 
278 aa  341  9e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  57.19 
 
 
278 aa  340  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  48.05 
 
 
273 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  45.85 
 
 
273 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  46.21 
 
 
273 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  42.01 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  42.01 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  41.64 
 
 
270 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  41.64 
 
 
268 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  40.15 
 
 
287 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  36.99 
 
 
271 aa  171  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 
406 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 
283 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  33.47 
 
 
430 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  32.57 
 
 
287 aa  142  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  36.56 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  36.56 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  36.56 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  36.56 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  34.57 
 
 
280 aa  139  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  36.73 
 
 
279 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  37.17 
 
 
279 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  37.17 
 
 
279 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  33.48 
 
 
280 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  37.72 
 
 
280 aa  136  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  38.14 
 
 
280 aa  135  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  30.34 
 
 
409 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  36.56 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  35.4 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  34.19 
 
 
280 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  35.02 
 
 
278 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  36.28 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  33.91 
 
 
278 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  30.7 
 
 
270 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 
285 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  29.09 
 
 
280 aa  122  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  30.71 
 
 
413 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  32.86 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  33.03 
 
 
410 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  28.74 
 
 
399 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 
282 aa  89.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  30.99 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  26.41 
 
 
282 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  25.53 
 
 
351 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 
300 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 
284 aa  85.9  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 
299 aa  85.5  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  25.95 
 
 
282 aa  85.5  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  27.84 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.6 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  27.72 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  29.78 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  29.78 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  27.8 
 
 
275 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.89 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  25.64 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  25.64 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  26.38 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  26.15 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  28.36 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  28.04 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  29.5 
 
 
455 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  27.66 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  25.76 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  27.51 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  23.62 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  30.1 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2515  putative signal transduction protein  25.45 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  30.26 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  29.79 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  28.65 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.32 
 
 
517 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  31.25 
 
 
512 aa  72.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  28.43 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  24.91 
 
 
456 aa  72.4  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  25.82 
 
 
324 aa  72  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  27.09 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  28.67 
 
 
718 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  29.35 
 
 
408 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  24.88 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  26.11 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  29.32 
 
 
724 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  25.96 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  24.37 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  27.66 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  27.03 
 
 
544 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>