286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1039 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  100 
 
 
273 aa  558  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  54.63 
 
 
276 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  53.3 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2028  putative signal transduction protein  46.97 
 
 
279 aa  229  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  44.87 
 
 
282 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  40 
 
 
282 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  38.79 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  39.15 
 
 
285 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  39.15 
 
 
285 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  33.85 
 
 
281 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  34.12 
 
 
283 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 
288 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  32.52 
 
 
288 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  32.42 
 
 
300 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  31.55 
 
 
288 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1838  metal dependent phosphohydrolase  30.35 
 
 
395 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1923  metal dependent phosphohydrolase  30.35 
 
 
395 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  30.5 
 
 
303 aa  95.9  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  31.12 
 
 
397 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 
285 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  31.36 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  29.77 
 
 
287 aa  92.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  29.77 
 
 
406 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  28.4 
 
 
397 aa  89.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 
412 aa  88.6  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 
455 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  30.17 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  25.55 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 
283 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  30.63 
 
 
299 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 
409 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 
283 aa  85.9  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  30.18 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  28.97 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  30.26 
 
 
912 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  34.42 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  29.65 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  30.77 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  29.72 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  33 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  27.91 
 
 
297 aa  79  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  31.61 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  26.92 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  29.12 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  29 
 
 
352 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  34.17 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  31.11 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  29.44 
 
 
718 aa  76.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  29.95 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  28.12 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  26.11 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  26.37 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  25.39 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  25.99 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  29.35 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 
544 aa  75.1  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  28.88 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  30.26 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  27.43 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  23.43 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  28.34 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  30.54 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  29.41 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  27.87 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  26.48 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  29 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  26.23 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  29.19 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  27.56 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  29.49 
 
 
730 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  30.57 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  30.09 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  30.57 
 
 
278 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  29.15 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  28.57 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  30.81 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  31.97 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  31.97 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  31.97 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  31.97 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  29.41 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  30.52 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  30.39 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>