257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1380 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  100 
 
 		 270 aa  531  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  32.54 
 
 		 430 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  29.39 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  30.7 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  30.83 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  30.45 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  29.18 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  32.62 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  33.2 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  29.96 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  33.2 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  31.52 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  31.42 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  27.17 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  30.91 
 
 		 399 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  28.52 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 		 409 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  32.11 
 
 		 410 aa  99.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  27.34 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  25.84 
 
 		 278 aa  95.5  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  29.73 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  29.73 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  28.89 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  28.49 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  28.49 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  28.49 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  28.49 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  28.49 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  29.73 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  26.88 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  27.2 
 
 		 280 aa  89  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  26.69 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  26.34 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  28.09 
 
 		 413 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  26.97 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  26.42 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  25.86 
 
 		 283 aa  85.9  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  26.58 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  25.6 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  23.89 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  27.68 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  23.39 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  22.05 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  23.16 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  25.93 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  26.11 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  27.87 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  25.93 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  27.72 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  25.79 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  26.18 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  23.15 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  26.2 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1923  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1838  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  24.47 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  23.12 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  23.66 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  25.88 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  24.51 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  25.85 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  23.79 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  24.76 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  27.7 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  23.65 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  27.45 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2515  putative signal transduction protein  24.76 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  23.23 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2028  putative signal transduction protein  23.16 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  29.32 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  28.07 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  24.52 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  23.19 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0189  signal transduction protein  28.41 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  23.87 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  29.86 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 703 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  26.87 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  24.03 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  26.42 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  23.32 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  27.14 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1053  diguanylate cyclase  35.57 
 
 		 519 aa  62.4  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  23.32 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  23.32 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  28.29 
 
 		 266 aa  62  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  27.21 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  27.88 
 
 		 718 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  23.77 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.36 
 
 		 642 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  25.23 
 
 		 505 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>