284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0013 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  532  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  95.49 
 
 		 347 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  95.11 
 
 		 347 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  95.49 
 
 		 347 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  84.96 
 
 		 346 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  85.34 
 
 		 346 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  84.96 
 
 		 346 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  83.83 
 
 		 346 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  84.59 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  68.91 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  66.54 
 
 		 354 aa  360  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0011  putative signal transduction protein  63.53 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000072807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  60.15 
 
 		 351 aa  342  4e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  65.93 
 
 		 351 aa  338  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000360962 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  33.07 
 
 		 384 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0287  hypothetical protein  33.61 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 324 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  35.45 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 397 aa  89.4  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  28.96 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  27.19 
 
 		 718 aa  82.8  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  30.14 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  31.21 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.58 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2952  putative signal transduction protein  29.57 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.281688  normal  0.0690285 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  34.59 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  29.29 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  26.82 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.14 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  30.43 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  23.21 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  34.43 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  28.72 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  27.82 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  29.65 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  28.25 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3052  putative signal transduction protein  25.49 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  26.61 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  27.75 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  25.67 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  22.31 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  33.79 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  26.6 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  23.5 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  31.62 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  28.87 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  24.81 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  30.32 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2585  putative signal transduction protein  26.72 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  28.33 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  28.27 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  28.33 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  28.27 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  28.27 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  27.6 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  28.27 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  25.99 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  26.82 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  26.11 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  27.78 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  27.78 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  28.33 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  23.68 
 
 		 730 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  26.79 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  23.71 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 		 430 aa  65.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  32.47 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  27.32 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  26.63 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  27.27 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  25.48 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  27.78 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  29.38 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  23.51 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.26 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  27.62 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  28.29 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2028  putative signal transduction protein  24.74 
 
 		 279 aa  62  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  29.38 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  29.38 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  27.66 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  37.84 
 
 		 724 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  29.1 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3517  metal-dependent hydrolase HDOD  24.34 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0544  putative signal transduction protein  27.41 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>