210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1254 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  95.2 
 
 		 279 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  95.2 
 
 		 279 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  94.8 
 
 		 279 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  89.24 
 
 		 280 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  89.24 
 
 		 280 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  89.24 
 
 		 280 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  89.24 
 
 		 280 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  88.45 
 
 		 280 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  84.86 
 
 		 280 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  80.48 
 
 		 280 aa  421  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  80.88 
 
 		 280 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  78.09 
 
 		 280 aa  411  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  79.68 
 
 		 280 aa  411  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  74.9 
 
 		 280 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  76.49 
 
 		 280 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  39.2 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  40.59 
 
 		 280 aa  198  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  40.82 
 
 		 278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  32.23 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  34.13 
 
 		 278 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  34.13 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  31.22 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  35.45 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  36.18 
 
 		 278 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  31.34 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  30.85 
 
 		 270 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  31.73 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  31.73 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  32.86 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  32.07 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  30.35 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  31.34 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  32.98 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  31.69 
 
 		 430 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  28.7 
 
 		 406 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  25.74 
 
 		 399 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  27.05 
 
 		 409 aa  85.1  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  28.65 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  27.68 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  29 
 
 		 413 aa  78.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  30.18 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 		 544 aa  76.3  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  24.88 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  26.23 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  29.29 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  28.36 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  22.6 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  29.5 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0722  hypothetical protein  26.32 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  29.58 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  30.22 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  27.47 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2511  putative signal transduction protein  29.89 
 
 		 287 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003755  predicted signal transduction protein  24.65 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  29.5 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  26.97 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  26.18 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02629  hypothetical protein  24.19 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  24.8 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.23 
 
 		 655 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  26.79 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  26.67 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1388  putative signal transduction protein  25.77 
 
 		 282 aa  62  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  28.04 
 
 		 408 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  26.56 
 
 		 287 aa  62  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.55 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  24.6 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  27.84 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  31.34 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  24.37 
 
 		 730 aa  60.5  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  26.18 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  23.68 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 703 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 		 353 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  25.7 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  23 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  24.22 
 
 		 718 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  25.78 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  25.78 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2488  putative signal transduction protein  25.73 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  25.78 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  23.96 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  30.66 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  22.97 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  22.34 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  26.23 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>