296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1356 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  61.9 
 
 		 273 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  61.9 
 
 		 273 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  60.65 
 
 		 278 aa  358  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  65.07 
 
 		 270 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  60.65 
 
 		 278 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  63.97 
 
 		 268 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  60.29 
 
 		 278 aa  350  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  63.6 
 
 		 270 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  63.6 
 
 		 270 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  50.18 
 
 		 278 aa  293  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  48.05 
 
 		 277 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  43.67 
 
 		 287 aa  208  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  37.33 
 
 		 278 aa  175  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  38.74 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  34.94 
 
 		 406 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  35.55 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  34.66 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  32.83 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  32.13 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  31.82 
 
 		 430 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  35.32 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  35.32 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  34.86 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  34.41 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  35.32 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  34.86 
 
 		 280 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  32.16 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  31.13 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  32.27 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  32.91 
 
 		 409 aa  138  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  33.33 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  33.33 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  33.33 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  33.33 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  32.72 
 
 		 280 aa  135  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  31.22 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  30.8 
 
 		 413 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  29.96 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  27.84 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 		 410 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  27.78 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  26.27 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.31 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 		 282 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  26.5 
 
 		 282 aa  89  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  26.4 
 
 		 282 aa  89  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  24.86 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  28.72 
 
 		 509 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  27.53 
 
 		 290 aa  85.5  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  26.27 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  28.12 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25.35 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  28.8 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  28.37 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  27.43 
 
 		 469 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  29.57 
 
 		 724 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  29.15 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  26.8 
 
 		 718 aa  79.7  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  28.57 
 
 		 469 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  26.12 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  26.15 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  29.38 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  26.29 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  30.45 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  24.68 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  29.78 
 
 		 427 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  26.99 
 
 		 544 aa  75.5  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 		 378 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2511  putative signal transduction protein  27.59 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  22.87 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  21.97 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  22.42 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  26.69 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  25 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  25.31 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  24.47 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  31.06 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  24.89 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  24.47 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  24.37 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  24.78 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  26.19 
 
 		 467 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  25.36 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  24.9 
 
 		 467 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  24.45 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  21.15 
 
 		 297 aa  72  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  26.2 
 
 		 274 aa  72  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  25.42 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  29.09 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  22.5 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>