More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0064 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  74.73 
 
 		 467 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  74.51 
 
 		 467 aa  705    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  942    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  75.38 
 
 		 467 aa  714    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  94.19 
 
 		 465 aa  894    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  73.18 
 
 		 469 aa  675    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  78.49 
 
 		 466 aa  751    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  75 
 
 		 468 aa  700    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  73.18 
 
 		 469 aa  672    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  75 
 
 		 467 aa  710    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  44.05 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3720  putative signal transduction protein  44.18 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48460  signal transduction protein  50.27 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  35.8 
 
 		 422 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  28.39 
 
 		 456 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48470  hypothetical protein  56.47 
 
 		 90 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  27.85 
 
 		 280 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  31.48 
 
 		 340 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 297 aa  98.2  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  26.81 
 
 		 274 aa  96.7  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  30.25 
 
 		 397 aa  95.1  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  28.4 
 
 		 281 aa  94.4  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  25.86 
 
 		 280 aa  92.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.77 
 
 		 642 aa  90.9  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  28.05 
 
 		 283 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3043  putative signal transduction protein  33.03 
 
 		 276 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211419  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  25.5 
 
 		 284 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  25.59 
 
 		 279 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 		 279 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  25.21 
 
 		 284 aa  87.8  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 		 285 aa  86.7  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25.45 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  27.32 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  25.93 
 
 		 650 aa  83.2  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  23.5 
 
 		 427 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  26.89 
 
 		 297 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 		 284 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  26.53 
 
 		 280 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.34 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30.33 
 
 		 285 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  24.8 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  28.02 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  25.76 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  28.64 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.58 
 
 		 298 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  27.01 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  29.39 
 
 		 730 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  24.4 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  23.67 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  23.37 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.63 
 
 		 632 aa  76.6  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  29.63 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  27.89 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  27.08 
 
 		 718 aa  76.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  26.48 
 
 		 287 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  24.17 
 
 		 284 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  26.79 
 
 		 275 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  24.18 
 
 		 289 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 		 283 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  24.03 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  22.62 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  28.44 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.29 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  23.33 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  26.69 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  25.79 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  25.47 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  25.43 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  24.3 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  22.17 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  23.61 
 
 		 289 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  25.94 
 
 		 912 aa  73.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2001  HDOD domain-contain protein  26.61 
 
 		 272 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  27.23 
 
 		 282 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  28.64 
 
 		 317 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25.68 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  28.02 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  26.13 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.68 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.68 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  26.27 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  22.18 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  27.2 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  28.49 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1053  diguanylate cyclase  24.89 
 
 		 519 aa  70.5  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  24.88 
 
 		 716 aa  70.1  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  23.46 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1582  thiamine-phosphate kinase  26.61 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  25.78 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  24.91 
 
 		 297 aa  69.7  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3372  metal dependent phosphohydrolase  25.2 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  23.16 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>