More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4563 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  94.16 
 
 		 274 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  94.16 
 
 		 274 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  93.8 
 
 		 274 aa  529  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  87.23 
 
 		 274 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  87.23 
 
 		 274 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  86.86 
 
 		 274 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  86.86 
 
 		 274 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  64.62 
 
 		 277 aa  371  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  62.41 
 
 		 274 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  56.2 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  38.6 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  33.21 
 
 		 290 aa  188  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  41 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  39.25 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  40.09 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  37.05 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  31.69 
 
 		 280 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  31.8 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  36.27 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  31.63 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  29.02 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  31.19 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  31.6 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.69 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  30.69 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  30.43 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  28.7 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 353 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  28.77 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  27.44 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.6 
 
 		 634 aa  99.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.57 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  28.44 
 
 		 274 aa  98.6  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 		 340 aa  98.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  32.06 
 
 		 397 aa  98.6  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0544  putative signal transduction protein  29.96 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  28 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  25.43 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  32.88 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  26.24 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  27.73 
 
 		 288 aa  96.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.79 
 
 		 303 aa  95.9  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 		 291 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 		 289 aa  95.9  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 		 290 aa  95.5  8e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  31.13 
 
 		 378 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 		 544 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  26.48 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 		 407 aa  93.6  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  25.1 
 
 		 313 aa  93.6  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.66 
 
 		 632 aa  93.2  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  32.08 
 
 		 358 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  27.11 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  24.22 
 
 		 440 aa  92.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.39 
 
 		 517 aa  92.4  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  27.19 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  28.86 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  24.32 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  26.67 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  28.05 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  28.05 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  27.75 
 
 		 438 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  25 
 
 		 496 aa  90.1  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  24.77 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  23.75 
 
 		 456 aa  89.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  29.41 
 
 		 289 aa  89  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  22.42 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  26.61 
 
 		 634 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  27.4 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  28.77 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  30.09 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  31.96 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 412 aa  86.7  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  27.03 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  30.1 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  25.65 
 
 		 281 aa  85.9  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  25.39 
 
 		 718 aa  85.9  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  33.15 
 
 		 302 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  26.82 
 
 		 469 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  26.01 
 
 		 297 aa  85.5  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  29.78 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.12 
 
 		 642 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  23.71 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>