287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2279 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  100 
 
 
496 aa  1017    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  26.12 
 
 
297 aa  111  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  28.07 
 
 
280 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  24.14 
 
 
292 aa  104  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  30.88 
 
 
285 aa  103  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  28.26 
 
 
288 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 
288 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  26.16 
 
 
298 aa  98.2  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  26.96 
 
 
288 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  26.96 
 
 
274 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  26.96 
 
 
274 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  26.96 
 
 
274 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  25.91 
 
 
290 aa  96.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  25.1 
 
 
274 aa  94.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  25.98 
 
 
274 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  23.44 
 
 
353 aa  93.6  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  24 
 
 
304 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25 
 
 
274 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25 
 
 
274 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25 
 
 
274 aa  91.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 
285 aa  90.9  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 
287 aa  91.3  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  90.1  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
292 aa  89.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  25 
 
 
277 aa  89.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  29.1 
 
 
313 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  25.66 
 
 
299 aa  87.8  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  24.33 
 
 
544 aa  86.7  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25.61 
 
 
305 aa  86.7  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  31.16 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  23.91 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  26.01 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  24.06 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  25 
 
 
289 aa  84  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  32.49 
 
 
290 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  23.81 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  25.32 
 
 
287 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  24.54 
 
 
302 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  31.98 
 
 
290 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  31.98 
 
 
290 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  23.36 
 
 
297 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  24.12 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  24.91 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  24.63 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  24.17 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  32.78 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  24.03 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  24 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  27.69 
 
 
369 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  29.08 
 
 
288 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  28.02 
 
 
427 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  24.12 
 
 
284 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  24.04 
 
 
283 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  25.55 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  25.54 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  30.46 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  30.46 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  22.17 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  26.55 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0413  hypothetical protein  30.17 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  23.36 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  24.79 
 
 
297 aa  77  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  21.12 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  21.23 
 
 
282 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  22.18 
 
 
505 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  23.21 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  22.77 
 
 
275 aa  75.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  24.5 
 
 
274 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  27.38 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  25.52 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  21.89 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0875  signal transduction protein  27.89 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  24.9 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  22.76 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  22.05 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.4 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  26.9 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  23.02 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  24.64 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  24.08 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  23.53 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  23.56 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.12 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  22.32 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  23.4 
 
 
281 aa  73.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 
282 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  24.14 
 
 
456 aa  73.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  24.54 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  23.97 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  23.81 
 
 
297 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  24.38 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  24.54 
 
 
299 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  22.73 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  22.73 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  26.19 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>