More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3899 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
282 aa  580  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  61.59 
 
 
285 aa  368  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  61.23 
 
 
285 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  47.12 
 
 
282 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  42.09 
 
 
281 aa  248  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2028  putative signal transduction protein  43.8 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  42.64 
 
 
282 aa  225  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  43.02 
 
 
276 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  40.38 
 
 
275 aa  211  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  36.03 
 
 
283 aa  209  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  38.79 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 
282 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  29.09 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  27.71 
 
 
280 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  30.57 
 
 
397 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1838  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 
395 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1923  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 
395 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 
282 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  27.89 
 
 
283 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 
298 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  26.61 
 
 
297 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  27.89 
 
 
283 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 
427 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  28.06 
 
 
284 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  27 
 
 
397 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  27.47 
 
 
300 aa  99.4  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 
284 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.34 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  26.53 
 
 
297 aa  96.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 
285 aa  95.9  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
298 aa  95.5  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  27.55 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  25.56 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  29.76 
 
 
302 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  27.43 
 
 
304 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 
284 aa  92.4  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  27.16 
 
 
297 aa  92.4  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.23 
 
 
280 aa  92.4  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  28.63 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  28.06 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  25.65 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
290 aa  90.1  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  27.95 
 
 
378 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  25.78 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  25.78 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  26.29 
 
 
271 aa  89.7  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 
299 aa  89.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 
284 aa  89  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  25.55 
 
 
408 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 
397 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  26.27 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 
455 aa  87  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  24.89 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  26.18 
 
 
352 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  25.18 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  30.35 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  26.32 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  26.4 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  26.28 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  29.13 
 
 
517 aa  82.4  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  25.12 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2515  putative signal transduction protein  26.77 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  24.64 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  25.22 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  27.12 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  27.06 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  28.07 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  28.08 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  28.86 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  27.19 
 
 
281 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.92 
 
 
634 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  27.31 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  27.66 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  26.67 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  25.93 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  28.81 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  25.09 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  26.34 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  29.32 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  28.07 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  24.75 
 
 
544 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  26.94 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  27.13 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  28.25 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  27.68 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  28.25 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  28.25 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0608223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>