More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2482 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  100 
 
 		 292 aa  590  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  61.04 
 
 		 258 aa  294  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  55.06 
 
 		 274 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  55.06 
 
 		 274 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  50.76 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3420  putative signal transduction protein  53.76 
 
 		 275 aa  251  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3375  putative signal transduction protein  46.07 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.908625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  35.16 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  33.94 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  33.98 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  30.59 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  29.5 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  31.9 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  33.18 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  34.25 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  29.28 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  32.2 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  31.02 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  27.43 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  27.11 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  29.67 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  26.89 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  26.32 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  26.32 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  26.32 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  26.32 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  26.7 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  27.24 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  27.95 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  26.55 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  26.24 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  26.24 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  26.24 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  29.62 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  26.94 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  31.88 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  27.52 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25.33 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 		 412 aa  94.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  29.06 
 
 		 352 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  26.54 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  26.15 
 
 		 298 aa  92.4  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.88 
 
 		 412 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  26.69 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  31 
 
 		 378 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 		 397 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 		 544 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  30.97 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  25.75 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  28.1 
 
 		 351 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  27.41 
 
 		 456 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  28.83 
 
 		 283 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.55 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  31.1 
 
 		 285 aa  89  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  28.1 
 
 		 415 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  28 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  28.43 
 
 		 369 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  26.91 
 
 		 326 aa  86.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 		 425 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  26.37 
 
 		 505 aa  86.3  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  24.42 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 		 284 aa  85.9  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  27.49 
 
 		 281 aa  85.9  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  25.33 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  26.07 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  26.22 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  26.89 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  28.07 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  28.9 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  26.25 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  27.81 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  26.29 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  26.74 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  24.17 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1569  putative signal transduction protein  32.32 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  29.27 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  24.04 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  28.64 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  24.02 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  28.64 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  25.98 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  25.56 
 
 		 716 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3872  Metal-dependent hydrolase HDOD  27.13 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  27.45 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>