263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0544 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0544  putative signal transduction protein  100 
 
 		 265 aa  539  9.999999999999999e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1582  thiamine-phosphate kinase  42.91 
 
 		 272 aa  221  9e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1128  putative signal transduction protein  39.93 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0866  Metal-dependent hydrolase HDOD  40.6 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2001  HDOD domain-contain protein  41.79 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  37.74 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1928  putative signal transduction protein  34.52 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0275  hypothetical protein  31.14 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0247  hypothetical protein  31.14 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0298  hypothetical protein  30.84 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1199  putative signal transduction protein  30.57 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000261595  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0833  HDOD domain-contain protein  32.42 
 
 		 202 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.149096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  30.73 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.68 
 
 		 286 aa  99  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  30.27 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  29.96 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  29.89 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  29.89 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  29.57 
 
 		 274 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  29.57 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  29.57 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  29.57 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  28.9 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  25.68 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  30.88 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  28.32 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  25.32 
 
 		 399 aa  79  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  25.82 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.96 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.85 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  26.94 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  26 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  26.61 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  26.07 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  28.22 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  26.16 
 
 		 305 aa  72  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  26.53 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  25.51 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  29.3 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  26.29 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0373  hypothetical protein  23.05 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  24.77 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  25.32 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  25.52 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  25.56 
 
 		 351 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.23 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  26.27 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  27.03 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  25 
 
 		 496 aa  65.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  24.37 
 
 		 378 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  25 
 
 		 509 aa  65.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  25.35 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25.34 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  25.23 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  24.53 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  24.04 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  24.75 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  24.15 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  39.58 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.91 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  36.17 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  36.59 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  24.79 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  27.43 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  25.09 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  24.17 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  25.7 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  24.11 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  24.19 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  24.08 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  23.11 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  23.2 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  24.2 
 
 		 407 aa  62.4  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0714  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.2 
 
 		 524 aa  62  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  22.87 
 
 		 408 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  25.45 
 
 		 281 aa  62  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  25.91 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  29.86 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  24.62 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  23.88 
 
 		 718 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  25.84 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  24.89 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  24.89 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  23.36 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  27.41 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  22.78 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  22.8 
 
 		 634 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  24.07 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  21.61 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>