171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1928 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1928  putative signal transduction protein  100 
 
 		 260 aa  513  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0544  putative signal transduction protein  34.52 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1128  putative signal transduction protein  30.89 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2001  HDOD domain-contain protein  29.23 
 
 		 272 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0866  Metal-dependent hydrolase HDOD  30.92 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1582  thiamine-phosphate kinase  26.54 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  27.73 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0298  hypothetical protein  30.43 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0275  hypothetical protein  30.43 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0247  hypothetical protein  30.43 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0833  HDOD domain-contain protein  31.21 
 
 		 202 aa  85.5  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.149096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  26.15 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1199  putative signal transduction protein  25.74 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000261595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  24.56 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  24.56 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  24.56 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  24.56 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  24.31 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  23.68 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  23.68 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  23.68 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  23.68 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  23.68 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  24.63 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  22.67 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  24.17 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  23.5 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  24.14 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  24.74 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  20 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  23.43 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  22.01 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  24 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  21.32 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  22.5 
 
 		 280 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  22.12 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  22.52 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  21.5 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  21.89 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  22.49 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  20.8 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  22.83 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  22.5 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  24.2 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  22.12 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  30.53 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  21.64 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  21.64 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  22.47 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  21.64 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  21.64 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  18.78 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  20.79 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  21.55 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  19.84 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  22.37 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  21.78 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  22.89 
 
 		 397 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  22.11 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  22.28 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  21.83 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  22.11 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  20.59 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25.35 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  21.61 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0373  hypothetical protein  19.73 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  21.6 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  24.12 
 
 		 340 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  23.38 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  24.07 
 
 		 351 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0600  response regulator  29.73 
 
 		 380 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  20.9 
 
 		 303 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  24.72 
 
 		 415 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  22.22 
 
 		 346 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  21.84 
 
 		 286 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  21.5 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  21.13 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0704  hypothetical protein  20.81 
 
 		 279 aa  52  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.670441  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 		 824 aa  52  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  22.28 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  22.32 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  27.64 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  24.5 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  23.76 
 
 		 346 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  23.27 
 
 		 348 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  22.45 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  18.58 
 
 		 378 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  21.79 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  23.38 
 
 		 347 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  23.38 
 
 		 347 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0854  putative signal transduction protein  31.58 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1977  putative signal transduction protein  28.75 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  27.63 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  23.76 
 
 		 346 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  22.09 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  16.92 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  23.5 
 
 		 347 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  19.71 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  24.46 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  21.36 
 
 		 427 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>