292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1996 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  100 
 
 
274 aa  547  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  99.64 
 
 
274 aa  545  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  63.86 
 
 
288 aa  332  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3420  putative signal transduction protein  68.98 
 
 
275 aa  315  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  55.06 
 
 
292 aa  295  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3375  putative signal transduction protein  59.85 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.908625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  57.66 
 
 
258 aa  270  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  37.83 
 
 
275 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  30.57 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  32.11 
 
 
274 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 
280 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  33.79 
 
 
287 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  29.74 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  28.9 
 
 
275 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 
283 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  29.41 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  29.28 
 
 
277 aa  95.5  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.34 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  27.31 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.75 
 
 
286 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  25.99 
 
 
283 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  25.88 
 
 
283 aa  92.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  28.38 
 
 
274 aa  92.8  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.67 
 
 
303 aa  92.4  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  28.89 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  30.29 
 
 
292 aa  92.4  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.44 
 
 
412 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  28.89 
 
 
274 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  28.89 
 
 
274 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  28.89 
 
 
274 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  27.93 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 
284 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  23.55 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  25.29 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  27.48 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  27.48 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  27.93 
 
 
274 aa  90.1  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  28.5 
 
 
304 aa  89  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 
291 aa  89  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  28.43 
 
 
505 aa  89  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  29.15 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  26.39 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  32.71 
 
 
716 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  22.37 
 
 
300 aa  86.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 
285 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  26.7 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  26.6 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  20.8 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  24.27 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  24.5 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.46 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  28.25 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  25.57 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  27.05 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  26.74 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  24.32 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.47 
 
 
298 aa  79  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  27.56 
 
 
425 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  26.82 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  32.41 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  29.13 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  28.37 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  24.22 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  21.55 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  22.34 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3872  Metal-dependent hydrolase HDOD  28.08 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  32.66 
 
 
544 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  28.39 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  25.7 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  25.5 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  27.4 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  27.01 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  28.79 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  23.5 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  23.53 
 
 
517 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  30.71 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  27.91 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  29.43 
 
 
468 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  25.21 
 
 
351 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  24.74 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  28.64 
 
 
326 aa  68.9  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  21.5 
 
 
696 aa  68.9  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>