89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_48460 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_48460  signal transduction protein  100 
 
 		 373 aa  738    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  53.33 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  53.93 
 
 		 469 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  53.68 
 
 		 469 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  51.36 
 
 		 466 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  50.41 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  50.27 
 
 		 465 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  50.14 
 
 		 467 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  50.14 
 
 		 467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  50.27 
 
 		 467 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  50.27 
 
 		 465 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  40.77 
 
 		 456 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3720  putative signal transduction protein  35.61 
 
 		 464 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  33.91 
 
 		 422 aa  175  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  29.27 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  24.48 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  34.57 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3043  putative signal transduction protein  38.75 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211419  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  32.58 
 
 		 730 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5840  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.11 
 
 		 161 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 		 285 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.86 
 
 		 634 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  23.79 
 
 		 305 aa  54.7  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  27.93 
 
 		 281 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  28.49 
 
 		 292 aa  53.1  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  27.67 
 
 		 505 aa  53.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.21 
 
 		 642 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1541  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.19 
 
 		 162 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 		 280 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  24.14 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  26.25 
 
 		 282 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  26.56 
 
 		 283 aa  50.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  27.18 
 
 		 302 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.83 
 
 		 156 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  30.25 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  30.63 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  27.92 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5493  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.36 
 
 		 157 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.317787  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5904  hypothetical protein  29.52 
 
 		 157 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.515734 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  25.53 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1640  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.28 
 
 		 162 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.850648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0089  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  22.88 
 
 		 156 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.33 
 
 		 632 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2911  hypothetical protein  29.91 
 
 		 162 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.28 
 
 		 162 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0015255  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 		 285 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  23.57 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.21 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  30.3 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  28.4 
 
 		 716 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5372  hypothetical protein  26.89 
 
 		 162 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000389201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5009  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.28 
 
 		 161 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.483603  normal  0.195058 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  24.24 
 
 		 313 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  25.97 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1369  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  29.36 
 
 		 161 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  25.79 
 
 		 276 aa  46.6  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0394  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  29.36 
 
 		 161 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  29.36 
 
 		 161 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1189  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  29.36 
 
 		 161 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1448  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  29.36 
 
 		 161 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1535  YbaK  29.36 
 
 		 161 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101769  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0018  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  29.36 
 
 		 161 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187871  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0677  YbaK-like protein  25 
 
 		 162 aa  46.2  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  26.75 
 
 		 274 aa  46.2  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  26.11 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0038  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  29.36 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1923  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  26.2 
 
 		 280 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  24.08 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1838  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3187  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.52 
 
 		 157 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1719  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.36 
 
 		 162 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  31.45 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  25.28 
 
 		 289 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  28.29 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  28.98 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1733  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.36 
 
 		 162 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6360  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.36 
 
 		 162 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444519  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0600  response regulator  25.83 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  28.57 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  27.54 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  26.86 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  27.61 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  24.4 
 
 		 277 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  22.35 
 
 		 496 aa  43.1  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0986  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  22.37 
 
 		 159 aa  42.7  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.015482  normal  0.28852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>