More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0600 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0600  response regulator  100 
 
 		 380 aa  787    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2538  response regulator  34.57 
 
 		 370 aa  193  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.3 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2368  putative signal transduction protein  24.39 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374822  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  25.3 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2726  putative signal transduction protein  27.32 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  27.85 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3319  putative signal transduction protein  24.44 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02599  response regulator  23.73 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  31.16 
 
 		 274 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  26.58 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  29.5 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  26.76 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  26.14 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  31.48 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  24.6 
 
 		 467 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  24.56 
 
 		 283 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  26.95 
 
 		 299 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  29.19 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  25.55 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  24.65 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  29.19 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  26 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  29.45 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  25.87 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  26.82 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  24.21 
 
 		 467 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  28.08 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  28.48 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  28.28 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  24.21 
 
 		 467 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  25 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0833  HDOD domain-contain protein  30.12 
 
 		 202 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.149096  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  29.17 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  24.21 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0298  hypothetical protein  28 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  29.63 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0275  hypothetical protein  34.25 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  28.06 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  28.67 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0247  hypothetical protein  34.25 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  24.52 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  29.63 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  29.63 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  24.87 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  25.35 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  27.34 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  23.91 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  26.7 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  25.32 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  22.87 
 
 		 274 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  23.5 
 
 		 284 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  29.89 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  22.87 
 
 		 274 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  25.17 
 
 		 292 aa  57  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  22.87 
 
 		 274 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  27.16 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  23.81 
 
 		 274 aa  57  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  25.69 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  21.68 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  30.18 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2289  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 135 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  26.14 
 
 		 285 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  25.17 
 
 		 275 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  26.13 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  31.36 
 
 		 746 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  32.47 
 
 		 650 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 297 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  23.23 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  27.14 
 
 		 352 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  29.08 
 
 		 287 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  32.89 
 
 		 280 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  31.65 
 
 		 288 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  26.78 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  24.84 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  24.84 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  24.36 
 
 		 280 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  26.87 
 
 		 278 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 		 280 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  21.7 
 
 		 716 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4041  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 127 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  35.06 
 
 		 287 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  23.13 
 
 		 290 aa  54.3  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>