258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02599 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02599  response regulator  100 
 
 		 382 aa  748    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3319  putative signal transduction protein  72.01 
 
 		 373 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2726  putative signal transduction protein  37.74 
 
 		 365 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  30.26 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2368  putative signal transduction protein  30.89 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374822  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 		 412 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  27.76 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 283 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 283 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  29.78 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  28.91 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  30.21 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  35.18 
 
 		 275 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0600  response regulator  24.05 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  25.21 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  30.45 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  24.58 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  28.19 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  30.84 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  29.73 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  30.77 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  30.23 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  31.71 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  31.71 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2538  response regulator  27.4 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  31.71 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.06 
 
 		 634 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  30.73 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  32.52 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  25.33 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  28.42 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  30.56 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  29.11 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  28.21 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  28.79 
 
 		 274 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  28.79 
 
 		 274 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  25.66 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  28.79 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  29.7 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  31.82 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 285 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  28.79 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  28.36 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  29.18 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  29.9 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  26.77 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  28.28 
 
 		 716 aa  63.5  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  28.19 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  26.07 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 285 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  23.35 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0432  putative signal transduction protein  28.43 
 
 		 260 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.299689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  26.07 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 		 544 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  38.67 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  28.02 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  27.85 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  28.23 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  25.25 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  28.87 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  30.06 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  31.28 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  26.13 
 
 		 279 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.17 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  25.37 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  29.22 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  26.1 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  29.78 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  27.71 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2489  diguanylate cyclase  29.56 
 
 		 836 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  24.22 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  30.62 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  27.45 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  25 
 
 		 912 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  25.98 
 
 		 304 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  28.22 
 
 		 326 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  29.44 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  25.39 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1012  putative signal transduction protein  27.87 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  33.33 
 
 		 271 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  28.32 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2488  putative signal transduction protein  27.87 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 		 282 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>