274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3720 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3720  putative signal transduction protein  100 
 
 		 464 aa  948    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  44.91 
 
 		 467 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  45.27 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  44.18 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  44.66 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  43.39 
 
 		 468 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  43.5 
 
 		 467 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  43.26 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  45.95 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  43.5 
 
 		 467 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  44.72 
 
 		 469 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  39.68 
 
 		 456 aa  345  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  35.31 
 
 		 422 aa  269  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  29.04 
 
 		 456 aa  193  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48460  signal transduction protein  35.8 
 
 		 373 aa  191  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  29.36 
 
 		 281 aa  95.1  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.83 
 
 		 517 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 		 297 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  27.37 
 
 		 280 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  27.42 
 
 		 285 aa  90.9  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  25.58 
 
 		 283 aa  90.9  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3043  putative signal transduction protein  32.16 
 
 		 276 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 		 406 aa  87  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  27.27 
 
 		 305 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  26.96 
 
 		 650 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  31.75 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  27.24 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  27.55 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  25.58 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  24.32 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  28.91 
 
 		 290 aa  82.8  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  26.09 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1053  diguanylate cyclase  26.73 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  30.1 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  24.37 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  27.27 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  22.83 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  24.3 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  24.17 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  26.52 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  25.74 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  28.19 
 
 		 281 aa  76.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 		 340 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 		 285 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  28.07 
 
 		 730 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 		 292 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  25.71 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  23.61 
 
 		 505 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  25.68 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  21.43 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  25.21 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  24.76 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  24.9 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  26.02 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  25.24 
 
 		 283 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  25.5 
 
 		 287 aa  73.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 270 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  23.08 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  26.82 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  29.06 
 
 		 271 aa  72  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  28.95 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  22.59 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  25.53 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  25.4 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  28.91 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  25.74 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  24.77 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  31.09 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  21.86 
 
 		 284 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  25.12 
 
 		 280 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 718 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  24.78 
 
 		 280 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  22.13 
 
 		 280 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  27.3 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  26.17 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  25.3 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.8 
 
 		 297 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48470  hypothetical protein  39.02 
 
 		 90 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  24.08 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  26.44 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  21.03 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  24.75 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2368  putative signal transduction protein  29.76 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374822  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  28.04 
 
 		 716 aa  68.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  28.63 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  25.98 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  25.4 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  28.21 
 
 		 268 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  26.47 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25.35 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 		 299 aa  67  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  20.09 
 
 		 282 aa  67  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>