255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4389 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  100 
 
 		 270 aa  544  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  97.04 
 
 		 270 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  97.04 
 
 		 270 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  93.66 
 
 		 268 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  65.07 
 
 		 273 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  58.09 
 
 		 273 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  57.09 
 
 		 278 aa  315  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  56.99 
 
 		 273 aa  314  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  53.96 
 
 		 278 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  53.6 
 
 		 278 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  48.03 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  42.01 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  37.36 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  36 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  35.56 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  30.11 
 
 		 271 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  34.51 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  32.69 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  32.69 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  33.08 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 		 406 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  33.18 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  32.81 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  30.08 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  32.43 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  32.43 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  32.43 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  32.43 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  32.31 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  30.23 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  30.77 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  32.02 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  32.14 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  26.53 
 
 		 430 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  29.73 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 		 409 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  31.34 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  31.52 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  28.63 
 
 		 413 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  31.44 
 
 		 410 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  27.43 
 
 		 399 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  29.08 
 
 		 299 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.45 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  23.62 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  30.19 
 
 		 718 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  28.21 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  30.14 
 
 		 724 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  27.81 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  23.29 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2035  hypothetical protein  26.52 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268391  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 703 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  26.09 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 		 544 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  22.95 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  27.14 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  21.81 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  26.78 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  21.81 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  24.47 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  24.5 
 
 		 425 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  22.22 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  25.62 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  25.82 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  26.04 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  27.86 
 
 		 716 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2511  putative signal transduction protein  25.49 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  22.26 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  24.47 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.83 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  27.23 
 
 		 512 aa  62.4  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  22.34 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  24.88 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  22.75 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  35.64 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  26.63 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  23.68 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  31.13 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  24.47 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.5 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  23.16 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  23.68 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  26.04 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1053  diguanylate cyclase  28.12 
 
 		 519 aa  59.7  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>